Несмотря на все свои стратегические и коммерческие преимущества, несмотря на энергию, талант и гуманизм генерал-губернатора Йохана Морица Нассау-Зигенского, голландская Бразилия принесла политическое и экономическое разочарование. Там всегда было неспокойно. Официальные голландские экспедиции против Байи и нападения португальцев на Ресифи были одинаково безуспешными, но постоянная партизанская война продолжалась, в которой португальцы из Байи имели то преимущество, что знали эти места. Голландцы со своей стороны приобрели себе ценных союзников среди американских индейцев – некоторые из них таким образом нашли способ выразить португальцам свою давнюю вражду. Военные действия с обеих сторон были очень разрушительными. Противоборствовавшие стороны стремились нанести друг другу максимальный ущерб, ломая механизмы, сжигая поля с сахарным тростником и похищая рабов. Урон бразильской экономике был повсеместным и долговременным. Это обстоятельство среди других стало препятствием к привлечению голландских и немецких крестьян-иммигрантов, которых Усселинкс и другие теоретики рассматривали как основу населения голландских колоний. Объединенное королевство Нидерланды само постоянно воевало, но было успешным и процветающим. У ремесленников и фермеров было мало стимулов покидать свои дома и заниматься физическим трудом в точно так же раздираемой войнами тропической колонии. Немногие голландцы, помимо солдат, торговцев и чиновников, отправились в Бразилию, а те, которые поехали туда, жили в основном в городах. Производство сахара можно было сохранить только с помощью жителей-португальцев, которые управляли сахарными заводиками и плантациями; а их сотрудничества можно было добиться только посредством широких уступок, в частности путем предоставления свободы католического вероисповедания и свободы продавать свой сахар на свое усмотрение. Для компании-монополиста под управлением рьяных протестантов это была высокая цена. Сами голландцы часто ссорились по этому поводу; и им не удалось добиться к себе лояльного отношения со стороны своих подданных-португальцев, которые постоянно искали помощи у Байи. Реставрацию монархии в Португалии в 1640 г. голландцы сначала приветствовали как событие, разделившее и ослабившее силы их врагов. Компанию подтолкнули к тому, чтобы сократить свое тяжкое бремя расходов в Бразилии путем отзыва в 1643 г. из Бразилии Йохана Морица, а также сокращения численности своего гарнизона в Пернамбуку. Фактически голландцы в Бразилии сделали ставку на сохранение мирных отношений с Португалией. Здесь они просчитались. Реставрация королевской власти в Португалии пробудила национальную гордость португальцев. В 1645 г. в Пернамбуку вспыхнуло восстание при поддержке Байи. В 1648 г. губернатор Рио-де-Жанейро Сальвадор де Са – талантливый и предприимчивый адмирал – отбил у голландцев Луанду и начал изгонять их из фортов, в которых содержались рабы, в Анголе. И процветание, и безопасность Ресифи оказались под угрозой. Компания испытывала финансовые трудности, а поддержка в Нидерландах ее политики не была ни единогласной, ни полной энтузиазма. Многие голландцы предпочитали каперство или неорганизованную частную торговлю организованной монополии и были возмущены расходами и проблемами, которые навлекала на себя колониальная администрация. Более того, отношения с Английской республикой, обостренные торговой конкуренцией, ухудшались, и в 1652 г. разразилась война. Несмотря на огромное неравенство между Португалией и Нидерландами в богатстве и морской силе, компания не смогла оказать своему бразильскому правительству достаточную помощь. В 1654 г. после борьбы, исход которой оставался неясным почти до самого конца, голландцы были в конечном итоге изгнаны из Бразилии.