Эксперименты с увеличением числа гребцов закончились провалом, к середине XVI века стоимость содержания гребцов достигла такой величины, что потребовалось привлечь на эту должность менее дорогую рабочую силу. В результате три гребца на одной скамье стали грести одним веслом, а не тремя. Весло оснастили особым приспособлением, напоминавшим лестницу, призванным компенсировав разницу в высоте разных участков рукоятки весла. Это приспособление породило термин alia scaloccio (ступенчатая схема). Такая схема была менее эффективной прежней трехвесельной, но она позволяла использовать в качестве гребцов рабов, военнопленных и каторжников.
Опытным путем было установлено, что для того, чтобы новая схема позволяла галерам развивать прежнюю скорость, требуется вместо трех прежних гребцов четверо новых. Но это вело к росту водоизмещения корабля, а необходимость кормить более многочисленный экипаж привела к сокращению автономности галер. Наконец, поскольку гребцы теперь были не свободными матросами, а рабами и преступниками, они требовали повышенной охраны, что в еще большей степени раздувало численность экипажа. На каждой скамье сидел один квалифицированный гребец, трем остальным оставалось только копировать его движения. Численность экипажа, водоизмещение и скорость хода находились в сложном отношении друг к другу. Сложившийся баланс мог быть легко нарушен, особенно в условиях, когда приходилось наращивать нагрузку на корабли. Венецианская республика сохраняла прежнюю систему galia sottil на протяжении XVI века, исключение составляли только самые большие флагманские галеры (lantema). Османы также не спешили к переходу на новую систему комплектации галер гребцами, по крайней мере, до времени сражения при Лепанто в 1571 году никаких изменений на османском флоте не происходило.
С появлением тяжелых пушек на борту галер, конструкция корпуса претерпела некоторые изменения. Очевидным образом самую крупную пушку ставили на медиальной плоскости галеры. К началу XVI века корабельная пушка отливалась из бронзы и ставилась на колесный лафет, позволявший поглотить энергию отката. Боевую платформу, издавна имевшуюся на носу галеры, приспособили для размещения пушек. В некоторых случаях поверх орудийной батареи делали еще один этаж для солдат. В отличие от парусных кораблей, у которых пушки стояли по бортам, для чего приходилось прорезать орудийные порты, оснащение галер пушками проходило сравнительно просто.