Вследствие введения политики “военного коммунизма” и диктатуры пролетариата обострилось внутриполитическое положение в Украине. В ответ на давление тоталитарной системы развернулось антибольшевистское движение крестьянства. Фактически в Украине началась крестьянская война, которую официальная пропаганда называла “куркульской контрреволюцией”. Только в июле 1919 г. было зафиксировано 207 антикоммунистических выступлений на территории УССР. Вся крестьянская Украина восстала против большевиков. Особую роль в этой войне сыграли крестьянские партизанские отряды под командованием атаманов Григорьева, Зеленого, Махно, Орловского, Соколовского.
9 мая 1919 г. кавалер ордена Красного Знамени атаман Григорьев издал универсал к украинскому народу с призывом к борьбе с большевиками. “Народ украинский, народ замученный!.. — писалось в универсале. — Ты работаешь день и ночь, ты светишь фитилем, ты ходишь в постолах и в штанах из мешка, вместо чая ты пьешь горячую воду без сахара, а те, которые обещают тебе светлое будущее, эксплуатируют тебя, с тобой воюют с оружием в руках, забирают твой хлеб, реквизируют твою скотину и уверяют тебя, что все это в пользу народную (...) Народ украинский! Бери власть в свои руки! Пусть не будет диктатуры ни отдельного лица, ни партии! Пусть живет диктатура трудового люда, пусть живут мозолистые руки крестьянина и рабочего. Долой политических спекулянтов! Долой насилие справа, долой насилие слева! Пусть живет власть советов народа Украины!” Крестьянское движение было одной из главных причин падения советской власти в Украине летом 1919г. Под давлением деникинцев и объединенной армии УНР к концу августа 1919 г. советские правительственные учреждения вынуждены были срочно покинуть Киев. Советская власть в Украине, потеряв военную поддержку, политический авторитет и социальную опору, упала вторично.
В начале осени 1919 г. большинство территории Украины оказалось под властью генерала А. Деникина. И хотя деникинская власть ликвидировала политику “военного коммунизма”, декларировала восстановление свободной торговли, неприкосновенность права собственности и обещала провести земельную реформу, она не нашла поддержки у крестьянства Украины. К социальным мотивам неприятия белогвардейского режима в Украине добавился и национальный. Впоследствии в тылу Деникина развернулось массовое повстанческое движение. Важнейшую роль в разгроме деникинцев сыграли отряды Н. Махно.
27 сентября 1919 г. махновцы нанесли сокрушительный удар по белогвардейцам около с. Перегоновки. За два недели боев от деникинцев было освобождено около половины территории Украины. Успехи махновцев использовала Красная армия, которой удалось вытеснить белогвардейцев из Северной Украины. В начале января 1920 г. подразделения Революционной повстанческой и Красной армий встретились около Александровска. Махновцы заявили о своем намерении вести совместную борьбу с белыми. Однако другого мнения было командование Красной армии. Махно и его сторонники были объявлены вне закона и вынуждены были отступить. К концу января 1920 г. советская власть в Украине была восстановлена.
Снова началась национализация, была восстановлена трудовая повинность, проводились массовые репрессии против махновцев. В течение года в Украине были созданы органы принудительных работ, оборудовано 18 концентрационных лагерей.
Жестокая политика советской власти привела к развертыванию повстанческого движения. Возобновила свою деятельность Революционная повстанческая армия под руководством Н. Махно.
После победы над Врангелем все усилия большевиков были сосредоточены на ликвидации повстанческого движения в Украине. Наступление Красной армии вызвало революционный всплеск в Западной Украине. В Тернополе 8 июля 1920 г. было создано временное советское правительство Восточной Галиции — Галицкий революционный комитет во главе с В. Затонским, а на местах — уездные, городские и сельские ревкомы. Было провозглашено создание Галицкой социалистической советской республики. Галицкий ревком издал декреты об установлении советской власти в Восточной Галиции, об аннулировании всех законов австро-венгерской монархии и Польши, о конфискации помещичьих и церковных земель, о национализации банков и промышленности и др. Однако в 1920 г. большевикам не удалось закрепить советскую власть в Западной Украине и добиться ее воссоединения с УССР.
Борьба повстанцев против большевистского режима продолжалась до осени 1921 г. 28 августа 1921 г. Н. Махно с небольшим отрядом перешел границу Украины и был интернирован на территории Румынии.
Однако гражданская война продолжалась. Крестьянство упорно сопротивлялось диктатуре пролетариата и “военному коммунизму”. Оно было последней силой, которая продолжала борьбу с большевиками. Положить конец гражданской войне мог только политический компромисс между враждующими сторонами. Еще весной 1921 г. Ленин принимает решение о переходе к новой экономической политике. Введение нэпа прекратило гражданскую войну и на долгие десятилетия утвердило советскую власть в Украине.