Противоположность принципов протестантизма побудила католическую науку посвятить себя с особенным вниманием учению о первородном состоянии человека и о благодати. Как ранее, так и теперь это изучение привело к разногласиям. Вопросы, о которых идет речь, не могут быть с полной ясностью разрешены и на них всегда будут даваться различные ответы. Между тем тогдашнее время было особенно неблагоприятно для их спокойного обсуждения. После того, как строгие августиновские идеи о грехе и благодати были разъяснены реформаторами в смысле принципа предопределения, эти вопросы сделались для многих еще более проклятыми, чем были раньше. Дело в том, что некоторые из преклонения перед авторитетом великого иппонского епископа, желая сохранить их в полной неприкосновенности в той новой формулировке, которую они им придавали, подчас впадали в крайность. Первый спор возгорелся в Нидерландах. Другие еще большие пререкания возникли в Испании и Франции.
А) Бай и Лессий
Желая воскресить учение Августина, Михаил де Бай из Левена (1513–1589 гг.) пришел к следующим положениям. После грехопадения человек может по своим природным способностям только грешить. Действия неверующего, не предопределенного ко спасению, все греховны и заслуживают осуждения. При таком положении дела человек не с самого начала расположен к Божьей благодати. Последняя с его стороны встречает постоянно противодействие. Но хотя он и грешит в силу необходимости, тем не менее он свободен. Свобода несогласима только с насилием или внешним принуждением (violentia), но не с необходимостью (neccesitas). Эти положения были встречены весьма сочувственно. Но еще сильнее были противодействия. Прежде всего противниками их заявили себя профессора Таппер и Равештейн в Левене, а также бельгийские францисканцы. По инициативе их Сорбонна в цензурном порядке удалила из лекций Байя 18 положений и в том числе наиболее важные. Спор, таким образом, разгорелся. Он длился еще несколько лет до тех пор, пока Пий V в булле «Еx omnibus affictionibus» не осудил 79 положений Байя (1567 г.), с чем последний в конце концов после некоторых колебаний и сам согласился. (Mg. Linsenmann 1867).
Иезуит Леонард Лессий (1554–1623 гг.) из Лёвена в противоположность Байю вскоре развил другое учение, в котором признал преобладающее значение человеческой свободы за счет благодати. Согласно его воззрению, Бог дарует от вечности каждому человеку благодать, необходимую для его обращения, и каждый человек получит ее в свое время единственно в силу благости Божией; благодать дается из чистого благоволения к людям извечно. Но, с другой стороны, человеческая воля одна должна рассматриваться как основание, почему у одних gratia sufficiens превращается в gratia efficax, а у других нет. Подобным образом предопределение должно быть относимо к сверхъестественным средствам спасения, превышающим первую благодать, при чем к вечной жизни ведет praevisis meritis gratia (prima vel sufficient) comparatis. Это учение, придав решающее значение в деле спасения человеческой, а не божественной воле, возбудило энергичные возражения и подверглось цензуре со стороны факультетов в Лёвене (1587 г.) и Дуэ (1588 г.). Римская курия исследовала эту теорию, но воздержалась от суждения.
В) Спор молинистов