Вся его жизнь была связана с Украиной. Иван Борисов родился 15 декабря 1800 года в Севске Орловской губернии, в семье священника. Еще в семинарии поразил всех своими неординарными сочинениями. С 1819 года он уже в Киевской академии, где студент Борисов превосходит всех. Его трактаты вошли в «Собрание опытов первого курса студентов Киевской Духовной Академии». После окончания Академии он – профессор Петербургской семинарии и ректор духовного училища. 10 декабря 1823 года он постригся под именем Иннокентий и занял кафедру богословских наук в Петербургской Духовной Академии. Вот тут и проявилось всё, что он постигал в Киеве. Широко пользуясь западной новейшей литературой, в основном протестантской, которую он читал в оригинале, Иннокентий в своих лекциях реформировал метод и постановку богословского курса. Вместо старой схоластической системы ввел историю догматов. Создал совершенно новые отрасли церковной науки: «основное богословие», «богословие сравнительное», «экклезиастику» (учение о составе и юрисдикции церкви). Как и в Киеве, Иннокентий лекций не писал, и они сохранились только в записях студентов. Блестящие художественные изложения молодого профессора вызвали восторг и возбудили интерес к науке у студентов, хотя «рутина» пыталась организовать на него гонения. Среди многих его произведений того периода хочется остановиться на «Последних днях земной жизни Иисуса Христа». Одно из прекраснейших произведений духовной литературы показалось некоторым настолько либеральным, что, несмотря на особенный интерес к нему, труд смогли напечатать только после кончины автора.
Наиболее плодотворной была деятельность Иннокентия в Киеве. Если в столице от него избавились, переведя ректором Киевской Духовной Академии, то тут он нашел всеобщую любовь и поддержку. Особенно в лице митрополита Киевского Евгения. По мнению историков церкви, время ректорства и профессорства его в Киеве составляет, можно сказать, самый замечательный, блестящий период в истории высшего богословского образования в России. Первым делом Иннокентий по прибытии на новое место отменил преподавание оставшегося еще от Польши богословия на латинском языке. Иннокентий явился новатором академического курса, к которому относились философия, история, литература… И в эту сферу он внес небывалое дотоле оживление. Указывая новые методы наук, расширяя и обновляя программы, вникая сам детальнейшим образом во все частности преподавания, он постоянно находился на лекциях преподавателей академии, впоследствии доброжелательно разбирая их. Любил сам пересматривать сочинения учащихся, делать пометки, для того чтобы потом в непринужденной обстановке поговорить со студентами. Иннокентий обладал особым даром возбуждать в учениках любовь к знаниям, и многие его воспитанники прославились в научном мире.
Архиепископ Иннокентий (Борисов). Неизвестный худ., ок. 1865 г.
В Киеве ректор основывает духовный еженедельный журнал «Воскресное Чтение». В 1836 году Иннокентий возведен в сан епископа Чигиринского. Еще в Петербурге он был избран в действительные члены Академии наук. Когда через год скончался митрополит Евгений, кафедру киевского митрополита занял не менее знаменитый Филарет (Амфитеатров). Иннокентий вскоре оставляет профессуру, посвящая себя исключительно ректорским обязанностям и делам епархии, а главным образом, научным изысканиям и проповедничеству. Планы его были грандиозные. А жизнь короткой! Но с помощью петербургских и московских коллег он смог сделать довольно много. Полное собрание сочинений Иннокентия в 11 томах издано в 1871–1875 годах.
Из ученых работ назовем главные: «Памятник веры» – собрание символов и вероизложений христианского учения, подлинников и переводов от истоков церкви до позднего времени. Работая над ним в Киеве, Иннокентий смог довести его только до ХІІ века, но все-таки этот колоссальный труд был закончен; «История соборов вселенских и поместных, в их подлинных деяниях» – этот труд был завершен другими учеными; «Вертоград духовный» – хронологический сборник лучших проповедей всех времен и народов; «Церковный архив» – библиотека древних и новых сочинений по истории церкви; «Памятник Унии» – сборник материалов по истории раскола украинской церкви; «История русской церкви в связи с историей церквей славянских»; подробный «Богословский словарь»; «История христианства в Польше». Также под его редакцией вышли произведения духовных просветителей Петра Могилы и Захария Копыстенского. Он перевел православную литургию, годичный круг богослужебных песнопений на польский и молдавский языки. Проповеди Борисова читались повсеместно – от постоялого до императорского двора.