Патриарх обратился к ним с прежними увещаниями не суемудрствовать, не вторгаться в церковные дела, повиноваться своим архиереям и не вмешиваться в исправление книг, не имея для того «грамматического разума». Тут выступил вперед Никита и воскликнул: «Не о грамматике пришли мы с тобой толковать, а о церковном догмате!» И тотчас спросил: зачем архиереи, осеняя крестом, берут его в левую руку, а свечу в правую? Ему стал отвечать Холмогорский архиепископ Афанасий. «Я не с тобой говорю, а с патриархом!» – закричал Никита и бросился на архиепископа, но выборные стрельцы его удержали. Тогда Софья, встав со своего кресла, с негодованием начала говорить о том, что Никита осмелился бить архиерея в присутствии царских особ, и напомнила ему его покаянное, клятвенное отречение от раскола. Никита сознался, что приносил покаяние под страхом казни, но что сочиненный на его челобитную Симеоном Полоцким «Жезл» не отвечает и на пятую часть сей челобитной.
Софья приказала читать ту челобитную, которую принесли теперь раскольничьи отцы. В ней, между прочим, говорилось, что еретики чернец Арсений и Никон «поколебали душою царя Алексея». Услыхав такие слова, Софья снова встала и со слезами на глазах сказала: «Если Арсений и патриарх Никон еретики, то и отец наш и брат и все мы еретики. Такой хулы мы не можем более терпеть и пойдем вон из царства». Она сделала несколько шагов в сторону. Но бояре и выборные стрельцы уговорили ее воротиться на свое место. При этом она не преминула упрекнуть стрельцов в том, что они попускают таким мужикам и невеждам приходить к царям с бунтом, против которого остается одно средство: уйти царскому семейству в другие города и возвестить о том всему народу. Стрельцы встревожились такой угрозой и клялись положить свои головы за царские величества.
Чтение челобитной продолжалось с небольшими перерывами и возражениями. Когда оно окончилось, патриарх взял Евангелие, писанное рукою святого митрополита Алексея, и соборное деяние патриарха Иеремии, заключавшее в себе Символ веры, и показал, что этот Символ в новоисправленных книгах буквально тот же. А один из священников указал старообрядцам на книгу, напечатанную при патриархе Филарете, в которой разрешалось на мясо в Великие четверг и субботу! На это Никита пробормотал: «Такие же плуты печатали, как и вы». Затем, по причине наступивших сумерек, прение было отложено, и раскольники отпущены с обещанием издать о них особый указ. Вышедши к народной толпе, они подняли два пальца и кричали: «Тако веруйте, тако творите; всех архиереев перепрехом и посрамихом!» На Лобном месте они остановились и поучали народ. Потом отправились на Яузу в Титов полк, где их встретили с колокольным звоном; в Спасской церкви, что в Чигасах, отслужили молебен и, наконец, разбрелись по своим домам.