Государственная венгерская авиакомпания Malert получила шесть Ju-52/3m ge в 1937 г., с началом второй мировой войны самолеты «призвали» на службу в мадьярские ВВС. В составе 2-й транспортной эскадрильи Юнкерсы регулярно летали из Венгрии в район Дона, где действовали части 2-й венгерской армии. В сентябре 1942 г. немцы предоставили Венгрии один Ju-52/3m g7e (Werk Nr. 3208) в санитарном варианте. Венгерские Юнкерсы в феврале 1943 г. принимали участие в эвакуации мадьяр из Полтавы. В сентябре 1943 г. эскадрилья венгерских Ju-52/3m сменила обозначение на 102/1. пять из шести самолетов, некогда принадлежавших авиакомпании Malert, были уничтожены на аэродроме Бёргёнд американскими «Мустангами» 12 и 13 октября 1944 г. Единственный экс-гражданский венгерский Юнкерс летал в окруженный советскими войсками Будапешт с 24 декабря 1944 г. вплоть до падения венгерской столицы 13 февраля 1945 г.
В 1939 г. два Ju-52/3m g4e получили ВВС Болгарии. В Болгарии самолеты получили гражданскую регистрацию LZ-UNA и LZ-UNB. Экипажи Юнкерсов прозвали свои самолеты совами. В 1943 г. Болгария купила в Германии еще два Ju-52/3m (Ju-52/3m g10e). В сентябре 1944 г. Болгария перешла на сторону стран антигитлеровской коалиции. В октябре германские войска окружили части болгарской армии в Ратунда-Дринаке. Не смотря на сильный огонь средств ПВО, Юнкерсы ВВС Болгарии выполнили 13 полетов и сбросили осажденным 14 т грузов. Несколько трофейных Ju-52/3m, захваченных на австрийском аэродроме Цельтвиг, были переданы Болгарии. Болгары использовали Ju-52/3m в качестве транспортных и десантных самолетов до середины 50-х годов.