Junkers 88A-14
Опыт боевого применения самолета Ju 88 выявил необходимость усилить вооружение самолета пушкой. Пушка требовалась не только для борьбы с истребителями противника, но и для поражения наземных целей.
В полевых условиях переднюю установку оснащали пушкой MG FF. Она крепилась на неподвижном лфете справа от места бомбардира. При этом бомбоприцел Lotfe снимали с самолета. «Глаз жука» при этом замазывали краской или закрывали листовым железом. Боезапас – 120 выстрелов в дисковых магазинах – хранился в кабине самолета. Существовала возможность переделки всех типов Ju 88А, однако ей подвергались, главным образом, самолеты Ju 88А-4 и Ju 88А-5. Самолеты, оснащенные пушками, использовали во многих частях, в том числе в KG 54. 30, 76 и 77, LG 1 и в разведке.
Успех Ju 88А, оснащенного пушкой, склонили фирму Юнкерса к разработке серийной версии Ju 88А-14. Самолеты Ju 88А- 14 несли пушку не внутри кабины, а в гондоле под фюзеляжем. Пушка размещалась в передней части гондолы, а на месте бомбоприцела находился эжектор гильз. В полевых условиях было переделано несколько Ju 88А-4, от серийных машин переделки отличались способом крепления пушки.
Junkers 88А-15
Ju 88А-15 представлял собой бомбардировщик Ju 88А-4 (SL+PC. W.Nr 140561, самолет также носил обозначение прототипа Ju 88V60), с бомбоотсеком увеличенного объема. С самолета сняли бомбодержатели и гондолу. От прежнего оборудования оставили только бомбоприцел Lotfe и перископ. Сокращенное бортовое вооружение состояло из двух пулеметов MG 15 или MG 811 в задней установке и пулемета MG 811 в передней установке. В хвостовой части самолета предусматривалось место для неподвижно закрепленного пулемета Рейнметалл- Борзиг MG 17 калибра 7.92 мм. Серийно Ju 88А-15 не выпускался.
Junkers 88А-16
Данная модификация представляла собой дальнейшее развитие учебно-тренировочного самолета на базе Ju 88. В современной литературе, посвященной Ju 88А-16, трудно установить к какой конкретно модели относился этот самолет. Некоторые источники утверждают, что это была учебная модель для Ju-88, другие, более многочисленные источники утверждают, что А-16 был учебной машиной для Ju 88А-15
Junkers 88А-17
Боевой опыт применения самолетов Ju 88А-4 'I гор показал необходимость выпуска малой серии торпедоносцев, обозначенных как Ju 88А-17. На самолетах этого типа не было подкабинной гондолы. На некоторых самолетах серии устанавливали морской радиолокатор FuG 200 HohenUveil.
Самолет Ju 88 А-17 использовали в некоторых боевых частях, в том числе в KG 26, 76 и KueFlGr 506.
Junkers 88В
Во время работы над проектами самолетов Ju 85 и Ju 88 было создано два типа кабины пилота. Кроме классической, которую потом внедрили в производство, создали и полностью остекленную кабину без уступа в передней части. Кабину похожей конструкции в последствии использовали на самолете Do 217K. Такие самолеты получили обозначение Ju 85В и Ju 88В. Был построен полный макет кабины Ju 85В.
В 1939 году проектные работы нал самолетом Ju 88В продолжились. Для испытаний взяли планер от Ju 88А-1. на который установили двигатели Jumo 213 мощностью 1102 кВт/1500 л.с. и комплексную кабину. Однако в воздушном комиссариате решили продолжать выпуск Ju 88А и ограничиться только маленькой серией Ju 88В.
В 1940 году двигатели Jumo 213 заменили на радиальные (двойная звезда) 14- цилиндровые двигатели BMW 801МА мощностью 1176 кВт/1600 л.с.