Наконец, тогда же 10 мая 1957 года Госэкономкомиссия СССР, давно ставшая костью в горле у Н.С.Хрущёва, была преобразована в Государственный плановый комитет СССР, который возглавил очередной хрущёвский приятель и выдвиженец, заведующий Отделом машиностроения ЦК Иосиф Иосифович Кузьмин, ставший одновременно первым заместителем председателя Совета Министров СССР. Как считают целый ряд историков, Н.С.Хрущёв не рискнул доверить этот ключевой экономический пост авторитетному и известному управленцу и посадил на это место преданного человека, который очень слабо разбирался и в экономической теории, и в хозяйственной работе. Старый Госплан СССР тоже был упразднён, а его руководитель Н.К.Байбаков с явным понижением был перемещён на должность главы Госплана РСФСР. Что касается М. Г. Первухина, то его тоже с понижением отправили руководить легендарным Минсредмашем СССР, который до него возглавляли два легендарных «сталинских наркома» Вячеслав Александрович Малышев и Авраамий Павлович Завенягин, безвременно ушедшие из жизни от непомерно ответственной и очень тяжёлой работы. Правда, на этом посту М.Г.Первухин задержится недолго и после разгрома «антипартийной группы» в июле 1957 года уступит этот пост своему заместителю Ефиму Павловичу Славскому, который будет возглавлять это министерство почти тридцать лет, до конца ноября 1986 года.
Сам управленческий состав всех совнархозов намеревалось обеспечить как за счёт номенклатуры упразднённых министерств и ведомств, так и местных кадров. Причём, судя по «Списку работников, рекомендуемых на должности председателей Советов народного хозяйства», датированному ещё мартом 1957 года, их отбирали из высшего номенклатурного состава министерств, как правило, с должности первого или «рядового» заместителя министра, а также начальников министерских управлений и даже ряда отделов, и очень редко — бывших министров[484]
. Уже к июлю 1957 года из 105 председателей Советов народного хозяйства 94 управленца были подобраны из состава центральных и республиканских министерств и ведомств и только 11 управленцев были рекомендованы рескомами, крайкомами и обкомами КПСС. На тот момент должности председателей региональных СНХ заняли 9 заместителей глав правительств четырёх союзных республик, 22 республиканских министра, 41 заместителей министра и 22 начальника главных управлений союзных и союзно-республиканских министерств. Причём, как указали ряд историков (В.Н.Горлов[485]), сроки и темпы переброски десятков тысяч высококлассных специалистов из центра в провинциальные совнархозы «были столь коротки и поспешны», что невольно создавалось впечатление, что «Н.С.Хрущёву очень не терпелось выслать из столицы влиятельных хозяйственников», на которых опирались Н.А. Булганин и другие руководители союзного правительства. При этом высший руководящий состав самих совнархозов, то есть начальники главных управлений, сводных отделов и директора крупных комбинатов и трестов набирались в основном из местных кадров, поскольку вся местная партийная бюрократия, которая и поддерживала эту реформу, была убеждена, что может обойтись без посланных «столичных начальников».Однако, даже вводя территориальный принцип управления, Совет Министров СССР принял решение о том, чтобы в центральных органах власти, например в Совете Министров РСФСР, были созданы территориальные и отраслевые группы по совнархозам, автономным республикам, краям и областям. Более того, начиная с 1959 года в аппарате Совета Министров РСФСР[486]
стали проводить укрупнение подразделений и объединять территориальные группы с отраслевыми. В результате предприятия машиностроения, чёрной и цветной металлургии, нефтяной, угольной и химической промышленностей оказались в одной группе, получившей наименование «тяжёлой промышленности». Таким образом, с самого начала отраслевой принцип управления де-факто сохранялся в виде отраслевых управлений совнархозов не только на местах, но и в центральном аппарате. Впоследствии отраслевой принцип управления только усиливался, в результате чего, как совершенно справедливо указали многие историки и экономисты, возникло одно из главных противоречий совнархозовской реформы: стремление сохранить централизацию управления при переносе основных управленческих функций на уровень самих регионов. Непонимание лично Н.С.Хрущёвым этого очевидного факта привело к тому, что недостатки в работе столь нетрадиционной системы управления народным хозяйством страны стали устраняться традиционным путём — укрупнением СНХ, когда всем стало очевидно, что темпы экономического роста, которые заметно выросли с началом их работы, вскоре стали резко снижаться.