Параллельно с созданием ВСНХ была проведена очередная реформа Совета Министров СССР, из прямого подчинения которого вывели все Госкомитеты. На их базе были созданы два типа комитетов: «производственные», такие как Государственный производственный комитет по среднему машиностроению СССР (Е.П.Славский) или Государственный производственный комитет по энергетике и электрификации СССР (П.С.Непорожний), и «управленческие», получившие статус Госкомитетов СССР: Госкомитет по авиационной технике (П.В.Дементьев), Госкомитет по оборонной технике (С.А. Зверев), Госкомитет по делам строительства (И.Т.Новиков), Госкомитет по судостроению (Б.Е.Бутома), Госкомитет по радиоэлектронике (В.Д. Калмыков), Госкомитет по электронной технике СССР (А.И.Шокин), Госкомитет по стандартам (В.В.Бойцов), Госкомитет по координации научно-исследовательских работ (К.Н. Руднев), Госкомитет по лёгкой промышленности (Н.Н.Тарасов) и т. д. Причём отныне все Госкомитеты СССР входили в систему ВСНХ СССР.
В результате всех этих «реформ» структура государственного управления в стране оказалась настолько запутанной, что в ней не всегда разбирались даже старожилы центральных аппаратов Совета Министров СССР и ЦК КПСС. Иногда дело вообще доходило просто до смешного: всего пару недель, 8-21 января 1963 года, просуществовал Госкомитет по электротехнике, который возглавил бывший председатель Чувашского СНХ Н.А. Оболенский, а затем его тихо «слили», включив в структуру Госплана СССР.
Лишь ровно через год после отставки Н.С.Хрущёва во исполнение решений сентябрьского Пленума ЦК 2 октября 1965 года Верховный Совет СССР принял Указ «О преобразовании некоторых Государственных комитетов в общесоюзные Министерства и об образовании общесоюзного Министерства общего машиностроения» и Закон СССР «Об изменении системы органов управления промышленностью и преобразовании некоторых других органов государственного управления», который поставил крест на столь ненавистной «совнархозовской реформе». В соответствии с этими нормативными актами восстанавливалась прежняя отраслевая система управления и в рамках Совета Министров СССР воссоздавались 12 союзных и 17 союзно-республиканских министерств, переформатировались союзный Госкомитет по науке и технике, а также Госплан СССР, Госснаб СССР и Госстрой СССР, получившие статус союзно-республиканских ведомств. Последним законом также упразднялись ВС.НХ СССР, СИХ СССР и все региональные совнархозы[490]
.Надо сказать, что в исторической науке до сих пор существуют совершенно разные оценки хрущёвской «совнархозовской реформы». Одни историки (Р.Г.Пихоя, А.В.Пыжиков, Ю.В.Аксютин[491]
) считают, что в целом она носила положительный характер, поскольку был серьёзно подорван партийный и министерский диктат над многими отраслями промышленного производства, усилилась кооперация различных производств в рамках самих экономических районов, уменьшились издержки по транспортировке сырья и готовой промышленной продукции, отчётность и т. д. Другие авторы (Н.П.Шмелёв, С.Г.Коваленко В.П.Мохов[492]), напротив, полагают, что практика управления советской экономикой посредством совнархозов себя не оправдала, поскольку: во-первых, эта реформа управления затрагивала не сущность, а только форму самой этой системы, которая по своей природе оставалась излишне централизованной и командно-административной; во-вторых, ответственность за экономическое развитие страны была в основном переложена с центральных на республиканские, региональные и городские органы государственной власти и управления, не имевшие достаточных финансовых и материальных ресурсов; в-третьих, в условиях сохранения централизованного государственного планирования и отсутствия рыночных механизмов эта реформа быстро привела к дезинтеграции всей советской экономики, в основе которой лежали давние, сформировавшиеся ещё в период индустриализации тесные производственные, отраслевые, межотраслевые и межрегиональные экономические связи и т. д. Поэтому сразу после отставки Н.С.Хрущёва новое руководство страны взяло на вооружение политику «сдирижированного консенсуса» во взаимоотношениях аппаратной верхушки и всех региональных властей. Наконец, третья группа авторов (В.Ю.Катасонов[493]) убеждена в том, что эта административная реформа нанесла первый и очень ощутимый удар по всей сталинской экономической модели, которая лежала в основе советского социализма, созданного в довоенный период. Именно эта реформа в конечном итоге резко снизила всю управляемость народно-хозяйственным комплексом страны, привела к общему падению очень высоких и стабильных темпов промышленного производства, столь характерных для всей сталинской мобилизационной экономики, и стала первым кирпичиком, положенным в фундамент новой редакции «нэповского госкапитализма в косыгинской упаковке», который уже в годы горбачёвской перестройки исполнил роль могильщика не только всей экономической модели советского социализма, но и самого советского государства.