За грехи граждан попустил Бог взять персам город Александрию, и святой стал готовиться к отправлению на родину. Узнав об этом, патриций Никита упросил его вместе с ним пойти в Константинополь и благословить царей. Видя благочестие патриция, святой, по любви к нему, согласился и вошел вместе с ним на корабль. Только они отплыли, как поднялась сильная буря и им стала угрожать опасность гибели. А ночью, во сне, патриций увидел, как патриарх в окружении нищих то попеременно обходит корабль, узнавая, нет ли в чем-то необходимости, то воздымает к Небесам руки, молясь Господу, чтобы Он успокоил море. И показалось патрицию, что Бог услышал Иоанна — море успокоилось, что и случилось на самом деле. После того, как утих ветер, они прибыли в порт Родоса и там патриарх не во сне, но наяву увидел Ангела в человеческом образе, сияющего ярче солнца и держащего в руках золотой скипетр. Ангел сказал ему: «Царь царствующих приглашает тебя в тот блаженный Город, где нет печали, и где будем вместе вечно радоваться». Тогда святой в огромной радости принес благодарение Всеблагому Богу, Который умилостивился над ним и извлек его из этой долины плача. После чего, обращаясь к патрицию, Иоанн сказал: «Ты, светлейший, старался отвести меня к земному царю, а меня позвал Небесный Царь царствующих». Сильно опечалился патриций, что лишается такого мужа, однако, облобызавшись с ним святым лобзанием, простился и отправился в Константинополь. А святой, в свою очередь, возвратился к себе на родину в Амафунт и тотчас же велел составить следующее завещание: «Убогий Иоанн, раб рабов Божиих, через архиерейское достоинство свободный, по благодати Христовой. Благодарю Тебя, Господи Боже мой, что сподобил меня вернуть Тебе все Твои дары, так что у меня ничего от них не осталось, кроме трех монет, которые я также повелю отдать моим во Христе нищим братиям. Ты Сам знаешь, Господи, что когда меня сделал епископом, я нашел восемь тысяч литр золота, которые раздал нищим, да и не только эти, но и те десятки тысяч, что Твоя благодать потом посылала мне. Я раздал все ради любви к Тебе, зная, что все это — Твое. Прими же душу мою, Святый Владыко». С этими словами он почил о Господе.
О, святейшая душа, о, неподражаемое благочестие, о, преданнеший слуга, поступавший как добрый раб и верный распорядитель, возводя монастыри и больницы, строя гостиницы и другие здания, необходимые для заботы о бедных и неимущих. Он одаривал Церковь, щедро и в изобилии помогая бедным, вследствие чего богатый в дарах Своих Воздаятель Бог прославил его совершением великих и дивных чудес и знамений и при жизни, и по смерти, из которых для уверения в истинности других, мы приведем одно-два, да и то вкратце, потому что мы и так уже значительно затянули наше повествование.
После того как в церкви чудотворца Тихона над святыми его мощами совершили положенное отпевание, их понесли, чтобы похоронить в склепе, где уже были погребены ранее два епископа. Когда стали опускать святого в склеп, тогда (о чудо!) тела двух прежде погребенных здесь епископов подвинулись сами по себе и расположились одно над другим так, что между ними образовалось место, куда и положили святого.
Выслушайте же и другое чудо, более удивительное.