Разбив и пленив Петра де Куртне, Феодор Ангел начал войну против Фессалоникийского королевства и в 1222 г. овладел его столицей. Молодой король Дмитрий, сын Бонифация, бежал в Италию, где вскоре умер. Королевство маркиза Монферратского пало после 18 лет существования первым из франкских государств, созданных Четвертым крестовым походом. В этом же году умер в Никее император Феодор Ласкарь, передав власть своему зятю, Иоанну III Ватацу, человеку умному и смелому. Захватив Фессалоники, второй по величине город Византийской империи, Феодор Ангел короновался короной императора ромеев (греков), тем самым бросив вызов Иоанну Ватацу и к тому же нарушив клятву верности, данную им в свое время никейскому императору Феодору Ласкарю и его преемникам. С точки зрения Феодора Ангела Дуки Комнина, потомка трех императорских фамилий, незнатный Иоанн Ватац не мог идти с ним ни в какое сравнение.
Трапезундская империя, возглавляемая братьями Алексеем и Давидом Комнинами, потерпела поражение в борьбе с союзниками, Федором Ласкарем и иконийским султаном рум-сельджуков, и, признав верховенство иконийского султана, отказалась от завоеваний и занялась морской торговлей.
Таким образом, на территории бывшей Византии образовались четыре империи: одна Латинская, в Константинополе, и три греческие: Никейская, Фессалоникийская и Трапезундская. Первые две греческие империи поставили себе целью овладеть Константинополем и поэтому столкнулись друг с другом. Иоанн Ватац успешно воевал против франков в Анатолии, построив флот, завоевал острова Хиос, Лесбос и Самос и, переправившись в Европу, овладел в 1225 г. Адрианополем. Однако здесь он встретился с императором Фессалоникийским Феодором Ангелом, который завоевал уже большую часть Фракии. Армия Феодора Ангела с помощью болгарского царя Иоанна Асеня II выгнала войска Ватаца из Адрианополя и подошла к стенам Константинополя. Казалось, еще немного, и Феодор Ангел восстановит Византийскую империю.
После смерти в 1228 г. императора Роберта трон занял его 10-летний брат Бодуэн II, младший сын Петра де Куртне. Для него нужен был регент. Было решено, что регент должен выдать свою дочь за малолетнего короля. Из двух кандидатур в регенты — болгарского царя Иоанна Асеня II и Иоанна де Бриенна — бароны и духовенство выбрали второго. В следующем году его 4-летняя дочь Мария от брака с Беренгарией Кастильской вышла замуж за 11-летнего императора (брак был осуществлен в 1234 г.), а Иоанн де Бриенн стал регентом, затем, в 1231 г., соимператором и носил корону императора до самой смерти в 1237 г.
Тем временем союзники-победители рассорились. Возможно, Феодор Ангел не простил Иоанну Асеню согласие стать регентом Константинопольской империи. Феодор вероломно напал на болгар, разгорелась война, и в 1230 г. в сражении между Адрианополем и Филиппополем Феодор был разбит и попал в плен. После этой победы болгарский царь получил Адрианополь и почти всю Македонию и Албанию, Остатки Фессалоникийской империи превратились в деспотат и распались на несколько владений. Надежды эпирской династии на константинопольский трон были похоронены навсегда.
Иоанн де Бриенн прибыл в Константинополь с небольшим отрядом. Он мужественно отбивался от объединившихся врагов — Иоанна Ватаца Никейского и Иоанна Асеня, обидевшегося на франков за отказ сделать его регентом в Константинополе. В 1235 г. они осадили Константинополь с суши и с моря. Город был спасен флотом из Венеции и войсками франкского Пелопоннеса (Морей). Впервые при защите города объединились венецианцы, генуэзцы и пизанцы. К моменту смерти Иоанна государство было представлено почти одним только Константинополем, со всех сторон окруженным никейскими владениями. Тем временем Иоанн Ватац укреплялся в Анатолии, покоряя мелких греческих и франкских правителей на берегу и островах Эгейского моря. В Никею ушла в изгнание греческая церковь.
Увидев более опасного врага в императоре Никеи, Иоанн Асень отошел от союза с ним и выступил защитником императора Константинополя. Он умер в 1241 г., и с его смертью закончилось время расцвета Второго Болгарского царства. Иоанн Ватац переправился с армией на европейский берег и в течение нескольких месяцев отвоевал у болгар все захваченные ими земли в Македонии и Фракии. В 1246 г. Иоанн Ватац овладел Фессалониками. Михаил II, побочный сын Михаила I, сохранил власть в Эпире с титулом деспота, под верховенством никейского императора. Иоанн Ватац остался единственным претендентом на императорский трон в Константинополе.