Аппарат министра: генерал-майор Юрий Эдуардович Садовенко
Национальный центр управления в кризисных ситуациях (создан 1.1.2007): Александр Миронов (с 1.2009)
Департамент пожарно-спасательных сил, специальной пожарной охраны и сил гражданской обороны: генерал-лейтенант Михаил Михайлович Верзилин (с 2007)
Департамент территориальной политики: генерал-полковник Юрий Павлович Ковалев (с 2006)
Департамент гражданской защиты: генерал-лейтенант Сергей Валентинович Шапошников (с 13.11.2006)
Департамент надзорной деятельности: генерал-майор Юрий Иванович Дешевых (с 2006)
Организационно-мобилизационный департамент: генерал-лейтенант Валерий Григорьевич Пантеленко
Департамент тыла и вооружения: полковник Николай Николаевич Гречухин (с 2008)
Департамент кадровой политики: полковник Михаил Борисович Николаевский (с 2009)
Департамент международной деятельности: Юрий Владимирович Бражников
Административный департамент: Сергей Павлович Выпряжкин (с 2009)
Финансово-экономический департамент: Максим Владимирович Лоскутов (с 2009)
Департамент инвестиций и капитального строительства: Лейла Донияровна Покровская (с 2009)
Научно-техническое управление: генерал-майор Виктор Павлович Молчанов
Управление преодоления последствий радиационных аварий и катастроф: Татьяна Андреевна Марченко
Управление медико-психологического обеспечения: полковник медицинской службы Сергей Киреев
Управление Государственной инспекции по маломерным судам: Вадим Вадимович Серегин
Управление авиации и авиационно-спасательных технологий: генерал-лейтенант Рафаиль Шакурович Закиров
Контрольно-ревизионное управление: генерал-майор Петр Александрович Орешников
Управление защиты информации и обеспечения безопасности спасательных работ: Эдуард Николаевич Чижиков (с янв. 2009)
Управление информации: Ирина Валентиновна Андрианова
Правовое управление: Андрей Александрович Москалец
Управление федеральной поддержки территорий: Хамзат Идрисович Беков
МИНИСТЕРСТВО ИНОСТРАННЫХ ДЕЛ РФ