Управление экономики и планирования: Татьяна Митрофановна Кущенко (с 2008)
Управление строительства и проектирования автомобильных дорог: Сергей Юрьевич Потапов
Управление эксплуатации и сохранности автомобильных дорог: Игорь Георгиевич Астахов (с 2009)
Управление научно-технических исследований, информационного обеспечения и ценообразования: Владимир Аркадьевич Попов (с 12.2.2009)
Управление имущества и правового обеспечения: Александр Анатольевич Каменцев (с 2008)
Управление делами: Андрей Евгеньевич Солодков (с 2009)
Управление кадров и организационного развития: Николай Иванович Бурносов
Финансовое управление: Татьяна Александровна Галкина
Управление платных автомобильных дорог и инвестиционных проектов: Игорь Владимирович Муравицкий (с 2009)
Управление транспортной безопасности (с 2009); Борис Борисович Суворов (с 2009)Управление инфраструктуры и перевозок: Владимир Михайлович Кисляков
Управление экономики и финансов: Мария Робертовна Винтер
Управление учебных заведений и правового обеспечения: Александр Юрьевич Панычев (с 2009)
Административно-кадровое управление: Андрей Михайлович Беспалов
Управление транспортной безопасности: Михаил Валентинович Теканов (с 2009)