Управление совершенствования функциональной деятельности: Матвей Анатольевич Тарасов (с сент. 2008)
Управление ведомственных программ: Денис Валерьевич Бриль (с янв. 2005)
Управление финансового прогнозирования и управления единым казначейским счетом: Анатолий Васильевич Букин (с 2005)
Операционное управление: Дмитрий Сергеевич Гришин (с янв. 2005)
Управление информационных систем: Андрей Михайлович Гусельников (с янв. 2005)
Управление режима секретности и безопасности информации: Александр Васильевич Косулин (с янв. 2005)
Административное управление: Вячеслав Павлович Романенко (с февр. 2009)
Управление внутреннего контроля и аудита: Наталья Алексеевна Логинова (с янв. 2005)
Управление бюджетного учета и отчетности: Галина Ивановна Маклева (с янв. 2005)
Юридическое управление: Светлана Николаевна Сауль (с янв. 2005)
Финансовое управление: Елена Павловна Яковлева (с янв. 2005)
МИНИСТЕРСТВО ЭКОНОМИЧЕСКОГО РАЗВИТИЯ РФ
12.5.2008 преобразовано из Министерства экономического развития и торговли РФ