Американским сухопутным силам отводилась ключевая роль в планируемой операции «Оверлорд» — высадка в Нормандии. Процесс концентрации сил союзников на Британских островах получил наименование «Болеро». В осуществлении этой операции лайнерам-трансатлантикам отводилась ведущая роль. Кунардовские «Королевы», а также «Аквитания», «Мавритания II», французский лайнер «Иль-де-Франс» и голландский «Ниев Амстердам» должны были организовать челночную переброску войск через Атлантику до полной победы над Германией. Только после этого рассматривалась возможность их перевода на Тихоокеанский театр.
«Куин Мэри» дебютировала в роли трансатлантического «челнока» 1 июня 1943 г., и в течение почти двух последующих лет совершала трансатлантические рейсы с той же регулярностью и частотой, что и в предвоенные годы. В каждом рейсе в восточном направлении судно имело полную загрузку — 1 5000 человек. А на обратном пути лайнер брал на борт несколько сотен пассажиров. Основной контингент составляли раненые, медицинский и технический персонал, а также дипломаты и бизнесмены. Перевозила «Королева» и военнопленных, которых затем размещали в лагерях на территории США.
Для того чтобы избежать чрезмерного скопления людей, способного повлиять на остойчивость судна, жилые помещения «Королев» были поделены на три сектора: «красный» (носовая часть), «белый» (середина судна) и «синий» (кормовая часть).
При посадке военнослужащий прикреплялся к одному из секторов и не имел права переходить в соседние. Солдаты в течение рейса развлекались как умели: читали, писали письма домой, играли в карты. Прием пищи на судне был событием: два раза в день — с 6.30 до 11 часов утра и с 15.00 до 19.30 — люди собирались в шести раздаточных, чтобы поесть и пообщаться. На это каждой из групп военнослужащих отводилось по 45 минут, после чего ее место в раздаточной занимала следующая смена.
Ротационный принцип применялся не только в кормлении пассажиров, но и в использовании спальных мест. Коек имелось лишь 12,5 тыс., еще 2,5 тыс. солдат спали на палубах. Ротация гарантировала, что ни один из пассажиров лайнера не проведет на палубе больше двух ночей, хотя в летнее время многие предпочитали сон на свежем воздухе ночевке в душном спальном помещении.
Для пущей предосторожности «Куин Мэри» никогда не ходила одним и тем же маршрутом дважды. Даже капитан до выхода в море не знал координат поворотных точек маршрута. В прибрежных зонах лайнер сопровождал эскорт из 4–5 эсминцев, затем эстафету принимали противолодочные самолеты или дирижабли, которые сопровождали судно, пока им позволял запас горючего. На другом конце Атлантики лайнер встречали бомбардировщики и летающие лодки, а затем — эсминцы, которые сопровождали лайнер до самого порта. Каждый раз появление эскорта было долгожданным, радостным известием для экипажа и пассажиров «Королевы». Это означало, что конец опасного путешествия близок. Особенно напряженными участками маршрута были подходы к нью-йоркскому порту и к устью реки Клайд: здесь лайнер снижал скорость и прекращал движение противолодочным зигзагом.
Как только «Куин Мэри» швартовалась в Гуроке, пассажиры начинали спускаться на берег по трапам из пассажирских дверей на палубах А, В и D. Процесс этот был весьма длительным и занимал от 24 до 36 часов. После разгрузки солдат размещали в зонах концентрации, а затем сажали на армейские грузовики и вывозили в лагеря в пригородах Глазго. При этом конвой грузовиков растягивался на многие мили.
Трансатлантическая челночная служба «Куин Мэри» продолжалась с июня 1943 г. по апрель 1945 г. За это время лайнер совершил 28 рейсов «туда-обратно», прошел 180 тыс. морских миль и перевез 340 тыс. американских и канадских военнослужащих — львиную долю союзных сил, переброшенных в Великобританию в ходе операции «Болеро».
Окончание войны в Европе не означало демобилизации «Куин Мэри» и других лайнеров: им предстояла долгая работа по репатриации американских военных. «Куин Мэри» вышла в первый послевоенный рейс из Нью-Йорка 5 июня 1945 г. Этот вояж разительно отличался от военных: на Атлантике установился долгожданный мир, можно было не опасаться подводных лодок, и потому лайнер шел прямым курсом, не используя зигзаг. (Правда, аппаратура размагничивания и все вооружение лайнера еще оставались на своих местах.) Ночное затемнение отменили, и 10 июня «Куин Мэри» впервые за долгие годы вошла в Гурок ярко освещенной. «Королеву» ожидал теплый прием.