После трагического конца ордена тамплиеров значительная часть их земель и имущества была передана госпитальерам. Орден и до этого владел огромными богатствами: обширными владениями в Европе и Малой Азии, окрестностях Галикарнаса (современный турецкий город Бодрум) и Смирны (турецкий Измир). С появлением же новых земель и владений иоанниты приобрели статус главного католического монашеского ордена в Европе. Он получал огромные доходы от своей собственности и использовал их для активной благотворительной и врачебной деятельности. Флот госпитальеров продолжал постоянную борьбу с мусульманским пиратством. В этот период орден становится не просто военным, а военно-морским. Именно флот, дальновидно созданный иоаннитами в период крестовых походов, обеспечил процветание ордена и позволил им избежать участи тамплиеров и тевтонов. И вплоть до конца восемнадцатого века флот госпитальеров сохранял свое военно-политическое значение.
Но не будем идеализировать мальтийских рыцарей. Да, огромные свои богатства они тратили на благотворительность, на помощь бедным и неимущим, но на море методы их борьбы мало отличались от методов мусульманских пиратов: так же захватывали заложников с целью выкупа, совершали набеги на поселения, охотились за торговыми судами. За что были прозваны
История собственно Мальтийского ордена начинается в 1530 году, когда рыцари получили от императора Карла Пятого в личное владение Мальту с двумя соседними островами – Гозо и Камино, взамен обязавшись охранять Средиземное море от турок и африканских корсаров. Условием владения островами стала ежегодная дань императорской короне в виде одного сокола. Дань эта регулярно выплачивалась вплоть до 1798 года.
Благодаря рыцарям жизнь на островах архипелага изменилась: активизировалась торговля и строительство. Мальтийцы стали строить госпитали и, главное, оборонительные сооружения и укрепления, что принесло работу и хлеб местному населению. А необходимые средства поступали от собираемых по всей Европе пожертвований, доходов, получаемых в собственных владениях рыцарей, а также добычи, захватываемой во время "караванов" – пиратских нападений на разбогатевших купцов-мусульман. Высшего расцвета слава Мальтийского ордена достигла в правление Великого магистра Ла Валлетта, при котором Мальте пришлось выдержать страшную осаду турок.
Современные мальтийцы с гордостью рассказывают о событиях, которые происходили в те далекие времена, об этом написано много книг, научных исследований и романов. И, действительно, есть чем гордиться! В течение четырех месяцев длилась осада крепости. Турецкий отряд, посланный на порабощение Мальты Сулейманом Великолепным, имел в наличии сто девяносто кораблей и не менее ста тысяч армии. Но госпитальеры, насчитывающие, по разным источникам, четыреста-семьсот рыцарей и шесть-семь тысяч солдат, неизменно отражали все атаки турок. С приходом подкреплений, присланных на остров по настоянию Папы Пиуса Пятого, туркам пришлось отступить, потеряв свыше двадцати пяти тысяч человек. Орден же за время осады потерял двести сорок рыцарей и пять тысяч солдат. А нанеся через несколько лет сокрушительное поражение турецкому флоту в морском сражении и подорвав тем самым турецкое государство, флот госпитальеров стал самой крупной военной силой на Средиземном море, обеспечив свободу судоходства европейских стран.
После победы над турками рыцари посвятили себя дальнейшей застройке и развитию Мальты и Гозо. Последовал расцвет архитектуры и культуры. Возникли великолепные постройки, которыми восхищаются и сегодня.
В семнадцатом веке в Европе стала меняться политическая и религиозная обстановка. Началась эпоха Реформации. Германские земли, Датское и Нидерландское королевства заявили о выходе из католической церкви. Это нанесло тяжелый удар по Ордену: многие Приорства вынуждены были объявить о своей независимости, а в Англии Орден становится вне закона и все его имущество конфисковывается. Некоторые европейские монархии все же продолжают поддерживать братство, так как боятся турецкой экспансии. Это давало возможность Ордену еще какое-то время сохранять свой суверенитет. Но уже в конце этого века средиземноморские государства создают свои собственные военно-морские силы, достаточные для того, чтобы защитить свои береговые линии.
Для чего им теперь содержать сильный мальтийский флот? А вот удобный порт и стратегическое положение острова оказываются большим соблазном для флотов Франции, Испании, Италии.