Новейшие генетические исследования, выполненные в Институте эволюционной антропологии имени Макса Планка в Лейпциге, позволяют, однако, предложить куда более сложную картину переселений наших предков в Европе в течение последних 500 000 лет. Согласно этому взгляду, предки современных людей, должно быть, через Северную Африку и Аравийский полуостров вошли в Европу 600 000 лет назад. На запад они распространились до Марокко, а на востоке предки современного человека разделились на неандертальцев и денисовцев, и на основании нового анализа общей геномной последовательности панафриканской смешанной пробы еще предстоит объяснить, были ли дальнейшие переселения. Они могли привести к перетоку генов от вымершей основной популяции современных людей в популяции, обитавшие к югу от Сахары. Это бы означало, что наши предки довольно активно мигрировали туда и обратно. Во время этих переселений они оставляли следы в геноме местных популяций; научным языком этот процесс называют интрогрессией, то есть передачей генов одной популяции в геном другой в результате повторных и возвратных скрещиваний. На эту архаическую интрогрессию со стороны некой «призрачной популяции» указывают доли генов этой популяции в геномах представителей населения регионов южнее Сахары; эти процентные доли весьма незначительно отличаются друг от друга: хоса (4 %), пигмеи мбути (4,3 %) и манденка (5,8 %). Если эти данные подтвердятся, то можно будет сделать вывод, что эта неизвестная популяция могла оказать большее влияние на оцениваемую долю наследственности неандертальцев в геномах населения Евразии, чем считалось до сих пор.
Более отчетливо реконструировано дальнейшее развитие неандертальцев и денисовцев. Последние прошли Ирак с юга на север и через Кавказ прошли к Каспийскому морю, а далее двинулись на Алтай (где их остатки были обнаружены в Денисовой пещере). Неандертальцы 500 000 лет назад проникли через Турцию и Грецию в Западную Европу, 400 000 лет назад достигли Северной Испании (Сима-де-лос-Уэсос), а далее дошли до Северной Германии. Одна отколовшаяся от них группа прошла через Месопотамию и горы Загроса в Иран и на Дальний Восток. Популяции неандертальцев и денисовцев остались в Европе, но сначала были разъединены. Затем, 100 000 лет назад, неандертальцы двинулись на восток и там смешались с денисовцами.
270 000 лет назад произошло первое переселение ранних современных людей из Африки через Левант в Европу, но оно не привело к образованию устойчивых поселений. Только вторая волна миграции, которая началась 70 000 лет назад в области Восточно-Африканского разлома, прошла через Аравийский полуостров и закончилась около 40 000 лет назад, смогла завершить этот важный шаг. Именно теперь происходит смешение современного человека и неандертальца. Появляется все больше свидетельств того, что в сравнении с современным человеком неандертальцы были вовсе не так тупы, как это считалось долгое время. Новейшие результаты исследований, проведенных в пещере Фигейра-Брава на берегу Аррабиды (30 км южнее Лиссабона), указывают, например, на то, что 100 000 лет назад у неандертальцев уже был достаточно разнообразный рацион питания, включавший рыбу, ракообразных, птиц и косуль. До сих пор антропологи исходили из того, что питание морскими продуктами, богатыми жирными кислотами омега-3, которое сыграло важную роль в развитии головного мозга, было характерно только для современного человека. Очевидно, что такой взгляд не соответствует действительности.
Смешение современного человека с неандертальцем можно сегодня считать твердо установленным фактом и можно утверждать, что наследственность неандертальцев составляет около 4 % генома современного европейца. Потомки неандертальцев и денисовцев были охотниками и собирателями, которые, выйдя из Восточной Азии, не позднее 11 500 лет назад (по некоторым данным 35 000 лет назад) по Берингии, перешейку, связывавшему тогда Азию и Америку, проникли на Североамериканский континент. Долгое время эта дорога была заперта ледниками. Только после их отступления освободился путь для переселенцев из Сибири. Они достигли Огненной Земли около 20 000 лет назад.
Некоторые из этих сибирских переселенцев по непонятным причинам отклонились от побережья и двинулись в высокогорья Южной Америки. В Тибетском высокогорье были обнаружены следы охотников и собирателей, живших там за 20 000 лет до переселения в Америку. Некоторые адаптивные признаки современных обитателей высокогорья в Южной Америке, индейцев кечуа и аймара, живущих на территории Боливии, Перу и Чили, похоже, вырабатывались на протяжении многих тысяч лет. Возможным основанием для столь широкого расселения наших предков до самых отдаленных уголков Земли – за исключением Антарктиды – было то, что с самого начала охотники и собиратели следовали за промысловыми зверями из Сибири через Берингов пролив в Северную и Южную Америку. Подобное поведение характерно и для современных кочевых народов Арктики.