За эти мужественные слова на святого обрушили настоящую грозу: он был избит, а после этого, весь в крови, через отдушину брошен в одну из находившихся под дворцом пещер. Поскольку пытки не могли укротить его непокорную душу, император попытался пленить его лестью. Если верить биографу святого, то получилось наоборот: вначале придворные из окружения императора постепенно стали более ортодоксальными в своих верованиях, потом и сам император, который против своей воли чувствовал влияние добродетели Мефодия, незаметно стал сторонником спокойствия и умеренности. О Феофиле и в самом деле известно, что он много занимался наукой. Мефодия ему представили как человека, который благодаря свойствам своего ума, широте своих познаний и своей проницательности больше всех способен помогать ему в научных исследованиях. После того как монаха поселили во дворце, император не мог обходиться без его знаний и даже брал его с собой в один из своих походов против сарацин.
Во время своих страданий Мефодий получал поддержку от двух знаменитых палестинских мелодов, Феодора и Феофана. Эти два брата были монахами в монастыре Святого Саввы и приехали в Константинополь в правление Льва Армянина, чтобы защищать в столице святое учение. После этого они вряд ли когда-либо покидали столицу, кроме тех случаев, когда их отправляли в изгнание. Сразу после освобождения они возвращались туда, где опасность была всего сильнее, и не боялись даже самих императоров. Их стойкость проверяли на прочность сначала Лев Армянин, а вслед за ним два его преемника – Михаил Заика и Феофил. Но ничто не могло принудить их отказаться от веры в иконы. Феодор защищал ее своими речами, Феофан своими стихотворными канонами. Их проповеди обратили в истинную веру большое число столичных еретиков и даже многих императорских чиновников. Именно Феофил приказал вытатуировать на лбах у этих двух исповедников написанное в стихотворной форме, ямбом, обвинение в нечестивости, вероотступничестве и преступной глупости. За эту надпись они получили славное прозвище Начертанные. Феодор умер в тюрьме, Феофан после восстановления православия был возведен патриархом Мефодием на кафедру митрополитов Никейских.
Еще один поэт, святой Иосиф Гимнограф (иначе Песнописец), чьи песнопения во славу икон производили глубокое впечатление на народ, а также знаменитый художник-монах Лазарь, чьи произведения красноречиво свидетельствовали о его верности старым верованиям, были подвергнуты жестоким пыткам. Монахи из монастыря Авраамитов, которые все вместе пришли к императору и высказали ему разумные предостережения, сразу после этого их выгнали из столицы, привели на берег Понта Эвксинского и избили палками до потери сознания.
Поскольку монахи были самыми горячими защитниками веры в иконы, их преследовали всюду, ожесточенно и безжалостно. «Не соблюдались никакие предосторожности, и Феофил, выйдя из себя, приказал закрыть все монастыри в населенных пунктах».
Но и тогда были монахи настолько отважные, что не боялись опасностей жизни в столице и приходили туда упрекать самого императора за жестокость и нечестивость. Феодор Студит умер 11 ноября 826 года, но его религиозная политика продолжала существовать и после его смерти. В этот второй период иконоборчества он был душой всего сопротивления, православные епископы, игумены и монахи постоянно консультировались с ним и повиновались ему, и он даже на смертном одре оставался уважаемым оракулом для своих современников. Он научил их иметь смелость отвечать самим государям, что «управлять делами государства положено им (императорам), но судить о церковных делах следует священникам и богословам. Ибо апостол сказал: „Бог установил в своей церкви сначала апостолов, потом пророков, в третью очередь ученых богословов, но нигде не упоминает об императорах. Это они (упомянутые) должны решать вопросы, связанные с догматами и верой. Вы же, императоры, должны им подчиняться и не присваивать их должность”». Примеры, которые приводил Феодор, бесчисленные письма, в которых он излагал свои взгляды, составленные им списки правил поведения, в особенности те, которые получил от него святой доблестный монах Мефодий, самый заметный представитель ортодоксальной партии, который обеспечивал сопротивлению единство направления и непрерывность, в итоге одержали победу над всеми крайностями императорского деспотизма.