На протяжении своего существования храм неоднократно страдал от пожаров. Каждый раз его восстанавливали, перестраивали и придавали новые архитектурные формы. Так, например, в 1737 г. шлемовидная глава была заменена на вазообразную, а щелевидные арочные окна стали прямоугольными.
В XIX в. к церкви была пристроена лестница, ведущая к западному входу, и маленькая часовня во имя Печерской Божией Матери, поэтому с тех пор время от времени церковь называли Печерской.
В древности церковь Ризоположения являлась собственностью патриаршего двора, домовой церковью. Отсюда митрополиты и патриархи выходили к Успенскому собору. В 1655 г. после постройки патриаршего двора и собора Двенадцати апостолов церковь Ризоположения перестала быть домовой церковью и была причислена к ведомству царского двора. В это время выстроили специальные крытые переходы.
Благовещенский собор. 1484–1489
В советское время храм несколько раз реставрировался. В 1920-х гг. разобрали позднюю пристройку южного фасада, восстановили белокаменный портал и растесанные окна. В 1950 г. восстановили первоначальный облик главы, а часовню во имя Печерской Божией Матери разобрали, после чего удалось открыть апсиды домовой церкви Св. Екатерины XVII столетия. Сейчас церковь Ризоположения приобрела свой первоначальный архитектурный облик.
Напротив Архангельского собора, неподалеку от Большого Кремлевского дворца словно зажженная свеча возвышается Благовещенский собор.
Первая каменная церковь Благовещения была выстроена в 1397–1416 гг., во время правления сына Дмитрия Донского, великого князя Василия. В 1405 г. роспись собора осуществили такие величайшие древнерусские художники, как Феофан Грек, Прохор с Городца и Андрей Рублев. К 1482 г. церковь настолько обветшала, что ее пришлось разобрать до подклета. На этом месте артель псковских мастеров возвела новый трехглавый храм из кирпича, с трех сторон окруженный открытой галереей-папертью, ранее называемой гульбищем, с выходом на Соборную площадь. В 1547 г. во время пожара Москвы храм сгорел. При Иване Грозном строение восстановили, добавив еще две главы. Паперть была перекрыта кирпичными сводами. На углах получившейся галереи устроили четыре маленьких придела в память о военной победе — присоединении к Русскому государству Полоцка.
В 1572 г. на юго-восточной стороне храма появилось крыльцо, которое несколько позже назвали Грозненским. Предполагают, что оно было выстроено по повелению Ивана Грозного после его четвертого брака. Известно, что Русская православная церковь допускает не более трех браков, четвертый венчать не разрешается. Цари также подчиняются этому закону и в случае ослушания должны нести наказание. Так, Ивану Грозному на несколько месяцев был заказан вход в любимую домовую церковь. Правитель все это время на специально возведенном крыльце отмаливал совершенный грех. Как истинный верующий, он каялся усердно, однако это не помешало ему жениться впоследствии еще три раза и мечтать о восьмом браке, благодаря которому Россия смогла бы породниться с Англией (это намерение не исполнилось, поскольку царь умер). После того как купола и кровли покрыли золочеными листами, девятиглавый храм получил в народе название Златоверхий.
Хотя в целом архитектурный стиль собора можно определить как раннемосковский, его облик определяют черты самых разнообразных древнерусских строительных школ. Четырехгранные столбы служат опорой для ступенчатых сводов. В центральную часть храма можно попасть через три входа — северный, западный и южный. Особенно красивы северный и западный, украшенные в XVI столетии белокаменными резными порталами и декорированные золотом и росписью, подобно порталам Архангельского собора. Медные двери, украшенные золотом, напоминают двери Успенского собора.
Своды и стены всех галерей богато расписаны мастерами разных времен и иконописных школ. Наиболее ранней композицией исследователи признают «Троицу», датированную XVI в. Пилястры стен в галерее украшены изображениями московских князей от Даниила Александровича до Василия III и, кроме того, древнегреческих философов Аристотеля и Платона, легендарного автора «Илиады» Гомера и римского поэта Вергилия.
В толще северной стены собора проделана узкая каменная лестница, ведущая на хоры. В древние времена здесь стояли службу женщины из царской семьи. Специальная площадка-переход соединяла женскую половину с великокняжескими палатами. Этот переход отреставрировали в XIX столетии при строительстве Большого Кремлевского дворца; можно увидеть его и сейчас.
Поскольку Благовещенский собор непосредственно примыкал к палатам великих князей, то с древних времен он считался княжеской домовой церковью.
Нижний этаж храма представляет собой подклет, оставшийся от белокаменного сооружения XIV столетия. Это маленькие тесаные помещения, сложенные из белого камня. Изначально эти помещения играли роль казнохранилищ.