Вторую линию дореволюционной историографии, касавшейся Московского университета начала XIX в., представляют работы, выходившие не в связи с институциональным изучением университета, подчиненных ему и начальствующих над ним структур, а исследовавшие различные персоналии и факты культурной жизни, в особенности литературного процесса, которые неотъемлемой частью входили в историю университета. Именно с последней трети XIX в., одновременно с публикацией большого количества мемуаров, начинается серьезное изучение биографий многих государственных деятелей, поэтов и литераторов, живших в 1800–1810 гг. Впервые появляются публикации, упоминающие об университетских годах Грибоедова, Чаадаева. Подробное описание молодых лет графа М. Н. Муравьева-Виленского дает его биограф Д. А. Кропотов. Выходят статьи, посвященные «забытым литераторам»: А. Ф. Мерзлякову (РС, 1879), М. Т. Каченовскому (Библиографические записки, 1892), М. Н. Муравьеву (ЖМНП, 1894). В 1880 г. А. А. Васильчиков, получивший доступ к богатейшему архиву семьи Разумовских, пишет исследование, значительную часть в котором составляет биография графа А. К. Разумовского, описание и оценка его деятельности на посту попечителя Московского университета и министра народного просвещения. Особой вехой в развитии литературоведения становится выход в 1885 г. собрания сочинений К. Н. Батюшкова с обширными комментариями Л. Н. Майкова и В. И. Сайтова, где впервые были собраны сведения о всех упоминаемых Батюшковым именах его друзей и знакомых, в т. ч. московских литераторах, многие из которых были связаны с университетом. Перед исследователями реально встала задача полного освещения культурной среды российского общества, которую пытались решать в своих словарях С. А. Венгеров и А. А. Половцов, но, к сожалению, ни одна из этих работ не была завершена.
150-летний юбилей университета, приходившийся на 1905 г., по понятным причинам не мог быть отмечен широко и не сопровождался крупными историческими публикациями. Отчасти этот пробел был восполнен во время другого юбилея — праздновавшегося в 1912 г. 100-летия победы в Отечественной войне. В этот год, наряду с множеством впервые опубликованных архивных материалов и исследований, посвященных различным эпизодам войны, вышли и работы, вводившие в оборот новые документы, связанные с отъездом университета из Москвы, пожаром здания и гибелью его имущества (К. Военский, В. Эйнгорн), а также обобщающая статья ректора университета М. К. Любавского «Московский университет в 1812 г.» (Чтения в ОИДР), вкратце излагавшая историю допожарного университета, останавливавшаяся на именах и характеристиках его замечательных профессоров первого десятилетия XIX в. и рассказывавшая о трагических событиях конца августа — начала сентября 1812 г.
В послереволюционный период традиция историографического описания Московского университета была прервана и не восстанавливалась в течение нескольких десятилетий. После прекращения деятельности ОИДР из всех научных обществ при университете только Общество испытателей природы чувствовало преемственность своей истории от времени начала XIX в. К своему 135-летнему юбилею ОИП выпустило книги С. Ю. Липшица «Московское общество испытателей природы за 135 лет», «Г. Ф. Гофман и его ученик Л. Ф. Гольдбах» и Б. М. Житкова «Г. И. Фишер», рассказывавшие об основателях общества и первом периоде его существования. Одновременно с этими работами большой коллектив историков подготовил серию статей под названием «Очерки по истории Московского университета», вышедшую в свет в юбилейном 50-м выпуске ученых записок МГУ. «Очерки» представляли собой первую попытку построения концепции университетской истории в советской историографии. В целом придерживаясь распространенного в то время социологического подхода, они рассматривали университет в качестве выразителя интересов господствующего дворянского класса, верного помощника правительства в борьбе с революционными идеями. В то же время некоторые объективные положения, перенесенные авторами из дореволюционных работ, делали концепцию несвободной от противоречий, за которые их резко критиковали в последующие годы: так, I очерках был сохранен тезис о положительном значении для университете либеральных реформ Муравьева, а в более раннем периоде подчеркивался позитивный просветительский характер деятельности И. Шварца и возглавляемого им Дружеского ученого общества.