Однако весной, в мае 1868 г., когда Пржевальский повторно находился в ст. Буссе, М. П. Тихменев встретился с Пржевальским и приказал ему принять под своё командование стрелковую роту, следовавшую из Хабаровки на пароходе «Телеграф» для защиты местного населения от нападения бандформирований хунхузов. Успешно выполнив этот приказание, Пржевальский отправился к месту своей дислокации.
За участие в боевых действиях Николай Михайловича досрочно представили к производству в капитаны и переведён в Генеральный штаб с назначением старшим адъютантом штаба войск Приамурской области, вследствие чего он отправился в Николаевск, где и прожил всю зиму.
Подводя итоги шестимесячной экспедиции, можно сделать вывод. Поручения, отданные Пржевальскому Генштабом, были качественно исполнены: все русские селения были описаны; произведена была приблизительная регистрация инородческого населения; собраны подробные сведения о состоянии сухопутных сообщений и о возможности движения по ним военных отрядов, более подробно были описаны пути, ведущие к границам Манчжурии и Кореи, а также и дороги из бассейна Уссури к берегам Великого океана. Все время регулярно производились систематические наблюдения температуры, давления атмосферы и вообще составлен был полный метеорологический журнал. По чисто научной части всё было исполнено с избытком. Он писал:
В отчёте Сибирского Отдела ИРГО за 1868 г. было сказано,
В начале февраля 1869 Пржевальский снова отправляется на оз. Ханка, чтобы закончить фенологические[128] исследования весеннего перелёта птиц. Здесь он пробыл до половины мая, почти три с половиной месяца, где занимался, пополнением зоологических и ботанических коллекций и другими исследованиями.
Заключительным актом Уссурийского путешествия явилась экспедиция в западной и южной части ханкайского бассейна, куда он командирован был с поручением отыскать там новые пути, как водные, так и сухопутные. Более двух месяцев Николай Михайлович передвигался по лесам, горам и долинам, или в лодке по воде.
После присоединения Уссурийского края к Российской империи по Айгунскому договору 1858 года, а также после заключения 1860 году Пекинского договора, в стране необходимо было провести организационно-правовые и территориальные преобразования на местах присоединения этих земель.
За несколько лет до этого события, на заключительном совещании Кабинета министров, посвящённом «каменноугольным и иным месторождениям на Дальнем Востоке 1856 года», всплыли вопросы устройства главного порта на Тихом океане[129]. Выяснилось, что слишком расходились мнения Восточно-Сибирского генерал-губернатора Генерал-лейтенанта М. С. Корсакова и начальника портов Восточного (Тихого) океана контр – адмирала П. В. Казакевича.
Командующий Сибирской военной флотилией вице-адмирал П. В. Казакевич, имеющий свой личный взгляд на данную проблему, писал:
Таким образом, представители Русских, как морского, так и сухопутного военных ведомств соглашались, что необходим план развития российского Дальнего Востока, но существенно расходились в определении приоритетов. Каждый «доказывал свою правоту с точки зрения своего здравого смысла».