Но тут-то разгорелись политические страсти. Противники эмансипации пустили в ход все средства, чтобы добиться от избирателей роспуска «Большого Совета», осмелившегося вотировать равноправие евреев. Для роспуска нужно было собрать не менее 6000 голосов избирателей, и ловким агитаторам это удалось. Собрание избирателей кантона Ааргау постановило: отозвать депутатов Большого Совета и назначить новые выборы. Ликующие юдофобы возвестили о своей победе над справедливостью иллюминацией — зажжением костров на вершинах гор. Однако новые выборы в Большой Совет снова дали перевес либеральной партии. В первом своем заседании Совет постановил устроить по спорному вопросу общенародное голосование в кантоне — референдум. В ноябре 1862 г. референдум состоялся и окончился поражением эмансипаторов: 26 702 голоса против 7733 были поданы за отмену закона 15 мая об избирательном праве евреев в кантоне Ааргау с 1863 года. Это вызвало взрыв возмущения во всех либеральных кругах Швейцарии и за границей. Учрежденный для борьбы за эмансипацию «Культурный Союз израэлитов», под руководством раввина в Ааргау, историка М. Кайзерлинга, обратился к Союзному Совету (Бундесрату) республики с петицией о пересмотре дела в порядке федерального управления. Бундесрат представил вопрос на обсуждение Союзного Собрания, которое приняло следующее решение (30 июля): потребовать от кантона Ааргау, «чтобы он более не препятствовал евреям осуществлять свои политические права в союзных и кантональных делах». Кантон Ааргау вынужден был подчиниться решению федерации, и 28 августа 1863 г. был наконец одобрен Большим Советом кантона закон о предоставлении местным евреям, как швейцарским гражданам, активного и пассивного избирательного права. Этим еще не был разрешен еврейский вопрос для всей Швейцарии. За пределы Ааргау евреев или вовсе не пускали, или допускали в редких случаях. Окончательная эмансипация совершилась несколько позже, главным образом под давлением иностранных государств.
Издавна Швейцария имела международные неприятности изза своего варварского отношение к евреям. В 1835 г. Франция приостановила действие своего торгового договора по отношению к Базельскому кантону за недопущение туда французских евреев. В 1850 г. произошел конфликт при заключении торгового договора с Соединенными Штатами Северной Америки. Швейцарское правительство указало в договоре, что в силу федеральной конституции только христиане пользуются свободою оседлости во всех кантонах; американское же правительство отказалось ратифицировать такой договор, нарушающий равноправие сторон, и потребовало, чтобы в Швейцарии не делали различия между американскими гражданами по исповеданию. Вскоре такой же конфликт возник и с Великобританией (1854). В начале 1863 года, когда в кантонах кипела борьба партий за и против эмансипации, голландское правительство также отказалось заключить торговый договор с Швейцарией, если голландским евреям не будет гарантирована свобода передвижения по швейцарской территории. Но сильнее всего подействовало на упорных швейцарцев аналогичное заявление французского правительства, перед которым защищал еврейские интересы парижский «Альянс Израэлит» (1864). Расторжение торгового договора с Францией было бы разорительно для маленькой альпийской республики, и ей пришлось смириться. Бундесрат в Берне уже примирился с мыслью, что швейцарская конституция не писана для иностранных евреев, положение которых регулируется международными соглашениями; но, с другой стороны, как же дать свободу жительства и торговли иностранным евреям, отказывая в ней своим? Сторонники эмансипации в союзном парламенте указывали на это затруднение в дебатах по поводу договора с Францией. Сам президент республики Дубе воскликнул: «Со стыдом должны мы сознаться, что в еврейском вопросе мы стоим одиноко или же в компании, которая хуже одиночества (намек на Россию). Мы стали посмешищем в европейском обществе, нас как бы предали отлучению». Палаты согласились на французские требования, а затем пришлось уступить и требованиям прочих государств по отношению к торговым договорам.