Параллельно с ликвидацией организаций, изучавших историю евреев, большевики не прекращали искоренение еврейских религиозных организаций: это было ещё не физическое уничтожение священников различных конфессий, а только ограничение их прав. Государственная антирелигиозная пропаганда велась согласно решению ВЦИК ещё с 1921 г. Евсекция принимала в ней активное участие. Её руководство осознавало, что влияние религиозных организаций на евреев можно устранить единственным способом
- установив над "религиозниками" полный контроль. Главным оружием в этой борьбе стали средства массовой информации, публичные лекции, диспуты и статьи в газетах и журналах. Публичные акции устраивались таким образом, чтобы евреи-священники не могли в них участвовать, т.е. в субботы, в дни постов и религиозных праздников.Особое внимание власти уделяли запрету на религиозное воспитание детей и религиозное образование взрослых.
Религиозным объединениям было запрещено владеть собственностью
, собирать налоги (кроме оплаты религиозных обрядов и пожертвований), регистрировать акты гражданского состояния, содержать лечебные и благотворительные учреждения, преподавать в советских учебных заведениях. Подчеркнём: это касалось всех конфессий. Власти были наделены правом закрывать религиозные объединения в связи с арестом их членов. Отправление обрядов и проведение церемоний не возбранялось. Но по всей стране закрывались синагоги, церкви, костелы и буддийские храмы; язычников власть также не жаловала.С 1925 г. антирелигиозной деятельностью "занялся" "Союз безбожников", руководимый Е. Ярославским - старым большевиком. Его члены сочиняли различные пасквили против священников и верующих, а также натравливали на них карательные органы. В 1930-х гг. сотрудники этих органов использовали факт причастности обвиняемого в нарушении закона к какой-либо религиозной общине как доказательство антигосударственного характера его деятельности. Особым гонениям подвергались служители культа, в том числе и еврейские. Последних, в частности умудрились обвинять в срыве планов развития Еврейской автономной области и (или) шпионаже в пользу нацистской Германии. Такое "искривление" идеологии интернационализма, проповедуемой большевиками после захвата власти, стало результатом сталинского курса борьбы с "врагами народа"
. В условиях назревавшего конфликта с нацистской Германией обострялась также и параноидальная подозрительность Сталина, в первую очередь к тем национальным меньшинствам, которые имели своё национальное образование за пределами СССР. Наиболее жёстко в годы большого террора пострадали поляки, финны, греки, немцы, латыши, эстонцы, литовцы. С 1936 г. началось массовое выселение, главным образом, немцев и поляков из приграничных районов. В период с лета 1937 г. по зиму 1938 г. ЦК ВКП(б) издал для НКВД СССР ряд директив о борьбе с румынскими, польскими, греческими и другими буржуазными националистами - агентами иностранных разведок. Представителей этих национальностей чаще всего арестовывали. По данным некоторых историков из 1 602 000 человек, арестованных в 1937-1939 гг. по политическим статьям уголовного кодекса, 346 000 были представителями нацменьшинств, причём 247 000 из них были расстреляны как иностранные шпионы. Из арестованных чаще всего казнили греков (81%) и финнов (80%). В заключении оказалось 16% проживающих в стране поляков, 30% латышей.Что касается антисемитизма, то период его замалчивания был относительно недолгим. С началом большого террора эта тенденция переросла в классовое оправдание ненависти к евреям.