Бывший председатель Комитета Михоэлс С.М., известный ещё до войны как активный националист, был своего рода знаменем националистически настроенных еврейских кругов".
Заканчивалась докладная так: "Среди арестованных за последнее время еврейских националистов МГБ СССР разоблачён ряд американских и английских шпионов, которые, будучи враждебно настроены против советского строя, вели подрывную работу". Но "меры к врагам народа" были Сталиным отклонены. Он ещё надеялся на успех проводимой им ближневосточной политики. Но его политика по отношению к палестинским евреям им же разрушалась политикой, проводимой по отношению к советским евреям. Правительству и народу Израиля было известно об этой политике больше, чем думал Сталин. Поэтому Израиль стремительно сближался с США, ускользая из сталинских объятий, а советские евреи продолжали испытывать терпение вождя демонстрацией возрождения своего национального самосознания. Поэтому вождь дал отмашку соответствующим органам.16 сентября 1948 г. был арестован киевлянин, поэт Д. Гофштейн, член президиума ЕАК, а аресты в Москве начались пять недель спустя. В декабре 1948 г. - январе 1949 г. было арестовано 15 человек, впоследствии осужденных "по делу ЕАК".
24 декабря 1948 г. были арестованы И. Фефер и В. Зускин, ведущий артист ГОСЕТ, друг и соратник С. Михоэлса. С. Лозовский был арестован 13 января 1949 г. Об этом старом большевике-ленинце Политбюро ЦК ВКП(б) постановило: "исключить Лозовского С.А. из состава членов ЦК ВКП(б) и из членов партии" за то, что он "сговаривался за спиной ЦК ВКП(б) с Антифашистским еврейским комитетом о том, как выполнить план американских капиталистических кругов по созданию в Крыму еврейского государства", а также "неоднократно принимал американских корреспондентов Гольдберга, Новика, являющихся американскими разведчиками, широко снабжая их секретными материалами о состоянии оборонной промышленности".
Эти аргументы были выдуманы недобросовестными следователями и вот почему: Пол Новик в США редактировал коммунистическую газету; Б. Гольдберг был агентом советской разведки.В первые месяцы 1949 г. был арестован главный врач клинической больницы имени Боткина, член президиума ЕАК Б. Шимелиович, давший "признательные" показания под ежедневными избиениями.
В первые месяцы 1949 г. МГБ арестовало писателей (Ш. Галкина, И. Добрушина, Ш. Персова и др.), журналистов и редакторов (М. Айзенштат-Железнову, С. Хайкина, С. Рабиновича, Г. Жица) и других лиц, имеющих прямое или косвенное отношение к ЕАК и газете "Эйникайт". Были арестованы директор (Л. Стронгин) и главный редактор (М. Беленький) издательства "Дер эмес", а также (29 января 1949 г.) Полина Жемчужина, жена В. Молотова, освобождённого от должности министра иностранных дел 4 марта 1949 г.
В общей сложности в связи с "делом ЕАК" были арестованы и осуждены по обвинению в шпионаже и антисоветской деятельности 110 евреев - деятелей культуры и науки.
Фактическим продолжением "дела ЕАК" стала "борьба с космополитизмом"
- организованное властями искоренение еврейской культуры и еврейских общественных организаций. Репрессии были направлены, прежде всего, против интеллектуальной элиты еврейского народа, хранившей и развивавшей его культуру и самобытность.С начала 1949 г. ЦК ВКП(б) разослал в обкомы, горкомы и райкомы партии письмо с сообщением о ликвидации ЕАК и решении правительства об аресте "уличённых в шпионаже" лиц, связанных прямо или косвенно с этой организацией. Так началась по всей стране
волна ликвидации еврейских культурных и научных учреждений и арестов тех, кто имел к ним отношение.