Однажды Армстронг заметил люк в полу своего кабинета в здании 16 в Райт-Филд. Он открыл дверь, увидел лестницу и спустился вниз. Он оказался в подвале, заставленном старыми станками и чертежными столами. Его внимание привлекла камера необычного вида , похожая на что-то из романа Жюля Верна. Она имела форму шара, была сделана из железа и имела окна, похожие на иллюминаторы подводной лодки. Это была первая и единственная армейская камера низкого давления, построенная несколькими десятилетиями ранее для школы летных хирургов времен Первой мировой войны. После войны школа, расположенная в Минеоле (Лонг-Айленд), была закрыта, и камера оказалась здесь, на аэродроме Райт-Филд.
Армстронга осенила идея. По соседству с его офисом инженеры армейских ВВС разрабатывали самолеты, которые могли летать быстрее, выше и дальше, чем когда-либо прежде. Армстронг хотел начать исследования и разработки по изучению медицинских последствий полетов на этих новых самолетах для пилотов. Он написал письмо на в инженерный отдел в Райт-Филд с просьбой о разрешении. Письмо было переслано в Вашингтон. Через некоторое время Армстронг был назначен директором Отдела физиологических исследований (позднее названного Лабораторией аэромедицинских исследований и другими вариантами этого названия) в Райт-Филд.
Его лаборатория начала работать. Механики цеха строили испытательные камеры из старых деталей самолетов. Он нанял ученого из Гарварда, доктора философии по имени Джон "Билл" Хейм. Используя добровольцев-испытателей, Хейм и Армстронг собрали данные о том, как организм реагирует на скорость, снижение уровня кислорода, декомпрессионную болезнь и экстремальные температуры. Но именно эксперимент на самом себе, с кроликом на коленях, стал легендарным для Армстронга.
Его интересовало, что же на самом деле происходит с человеческим телом на высоте более 10 000 футов. Почему и на какой именно высоте человек может умереть? Армстронг забрался в камеру низкого давления с кроликом на коленях. Его техник отрегулировал давление, чтобы имитировать высоту . В груди Армстронга стало тесно, суставы заболели. Когда он растирал руки, то чувствовал крошечные пузырьки вдоль сухожилий, которые он мог перемещать под кожей. Он предположил, что это пузырьки азота, образующиеся в его крови и тканях, и что смерть на большой высоте вызвана свертыванием крови. Армстронг указал технику, что нужно смоделировать еще большую высоту в камере. На нем была надета кислородная маска, а на кролике, сидящем у него на коленях, ее не было. Вскоре кролик должен был умереть. Когда лаборант повысил давление, кролик забился в конвульсиях и умер. Когда Армстронг вышел из камеры, препарировал кролика и обнаружил пузырьки азота, что доказывало правильность его гипотезы.
Открытие Армстронга стало важной вехой в авиационной медицине. Работая с Хеймом над новыми испытаниями, он ввел зрительную трубу в артерию подопытного животного. Они снимали данные о том, что происходит с телом млекопитающего на высоте сорок тысяч, пятьдесят тысяч и, наконец, шестьдесят пять тысяч футов. Они стали первыми свидетелями того, что жидкости в организме закипают на высоте 63 тыс. футов. Эта точка стала известна как "линия Армстронга". Это та высота, за которой человек не может выжить без скафандра.
В 1937 г. капитан Гарри Армстронг считался одним из пионеров американской авиационной медицины. 2 октября того же года он принял участие в первом международном съезде Aero Medical Association, который проходил в галерее "Астор" отеля "Уолдорф-Астория". Там он вместе с Хеймом доложил о результатах своих последних исследований, проведенных на аэродроме Райт-Филд. Одним из врачей, наиболее заинтересованных в этих исследованиях, был врач Люфтваффе, представлявший Германию, доктор Хубертус Штругольд. Эти два человека, Армстронг и Штрюгхольд, были пионерами в одной области. "Мы сразу нашли общий язык", - вспоминал Гарри Армстронг спустя десятилетия. Эта случайная встреча во многом определила дальнейшую карьеру Стругольда после нацистской войны.