Рокфеллеровская стипендия продлилась всего год. Вернувшись в Германию, Штрюгольд и фон Грейм продолжили начатое. Теперь фон Грейм управлял двухэтажным самолетом Udet Flamingo - спортивным бипланом, изготовленным из дерева. Чтобы определить, сколько сил g может выдержать человек, прежде чем его глазные яблоки получат повреждения, они поднимались высоко в воздух, затем пикировали вниз к земле , пока один из них не терял сознание .
В 1933 г. к власти пришел давний друг и коллега фон Грейма Адольф Гитлер. В нарушение Версальского договора Герман Геринг тайно обратился к фон Грейму с просьбой восстановить ВВС Германии. Благодаря личной дружбе с фон Греймом Штрюгольд вошел в этот ближний круг нацистской власти. В 1935 г. ему предложили работу, которая определила всю его дальнейшую жизнь. Став директором Авиационного медицинского исследовательского института рейхсминистерства авиации в Берлине, он оказался в высшем эшелоне медицинских исследований Люфтваффе. В лаборатории, расположенной в пригороде Шарлоттенбурга, имелась современная камера низкого давления и десятифутовая центрифуга, в которой испытуемые могли подвергаться воздействию гравитационного притяжения различной степени. В камере могли находиться как обезьяны , так и люди под давлением от пятнадцати до двадцати G.
Работа требовала времени, самоотдачи, а главное - самоотверженности. Рейху нужны были люфтваффе, чтобы помочь завоевать всю Европу. Именно поэтому Штрюгхольд собрал вещи и переехал в Берлин. Ему предстояло подчиняться непосредственно Эриху Хиппке, начальнику медицинского корпуса Люфтваффе, который подчинялся Герману Герингу. Для Штрюгхольда это был вертикальный карьерный шаг. С должности преподавателя в университете он поднялся на вершину командного звена авиационной медицины Рейха. Рейх располагал огромными ресурсами и желанием проводить новаторские эксперименты на благо своих пилотов. Это был риск, но за риском следовало вознаграждение. Для Штрюгхольда вознаграждение было колоссальным. В течение десяти лет он был одним из самых влиятельных врачей, работавших на Третий рейх.
В Берлине Штрюгольд рассматривал свою новую обширную лабораторию как прибежище для любителей риска . Коллеги, в том числе из нацистской партии и СС, заглядывали к нему, чтобы полюбоваться его работой с камерой низкого давления и центрифугой. Эксперименты проводились практически постоянно. Медицинские ассистенты Штрюгхольда постоянно позволяли подключать себя к этим странным приспособлениям с торчащими во все стороны трубками, клапанами и шлангами. Ассистенты, один с кислородной маской, другой без нее, позволяли запереть себя в камере низкого давления, чтобы определить, насколько высоко может подняться человек, прежде чем потеряет сознание. Во время одного из экспериментов за ним наблюдали два сотрудника министерства авиации Рейха. Человек без кислородной маски начал терять сознание. Сначала его глаза закрылись, затем голова опустилась на грудь. Второй человек, находившийся в камере в маске, оказал первую помощь. Потребовалось совсем немного времени, чтобы человек быстро пришел в себя.
" Все наши исследования очень рискованны , - сказал Штрюгхольд представителям нацистской партии. "Они требуют от ассистентов больших способностей и большой ответственности. Если человек не получит кислород... он может умереть через пять минут".
В то время как Люфтваффе готовило своих пилотов к войне, Штрюгхольд продолжал использовать своих сотрудников в качестве подопытных. Он также проводил эксперименты над собой. Говорят, что он "катался на центрифуге" целых две минуты, моделируя, каково это - испытывать пятнадцатикратную силу тяжести, управляя самолетом.