Поскольку церковь монастыря была посвящена Святому Кресту, изображения на фресках 1183 г. посвящены Распятию и Воскресению – они помещены в нише над гробом святого. Еще одна фреска с изображением Распятия (1196 г.) помещена над дверью, ведущей в церковь. На северной стене келлии, слева от гроба, св. Неофит изображен Феодором Апсевдисом коленопреклоненным у ног Спасителя, который восседает на троне, а по обеим сторонам в молении же к Нему обращены Пресвятая Богородица и св. Иоанн Креститель. На потолке написаны погрудные изображения пророков. На потолке, при переходе из келлии в алтарь (церковь), прп. Неофит изображен между архангелами Михаилом и Гавриилом, которые поддерживают его за плечи. Сам святой стоит в молитвенной позе, со скрещенными на груди руками. На обеих сторонах двери, связывающей алтарь и келлию, на фресках слева – Богородица, справа – Архангел Гавриил, над дверью – фигура Христа. На очень неровной поверхности потолка над алтарем – композиция Вознесения. Над алтарем, где в обычной церкви находится апсида, изображена Богородица Оранта и Отцы Церкви: Иоанн Златоуст, Григорий Богослов, Епифаний Кипрский и др., а также основатели египетского и палестинского монашества: Ефрем Сирин, Феодор Освященный, Пахомий Великий, Илларион Великий и др. В нефе (продольная часть церкви) на стенах изображено 8 сцен Страстей Господних, сделанных в 1196 г., «Молитва в Гефсиманском саду», «Предательство», «Христос перед Пилатом», «Несение Честного Креста», «Распятие Христово», «Снятие с Креста», «Плач», «Воскресение Христово». «Тайная вечеря» и «Омывание ног» написаны в 1503 г.
В ряду изображений XII в. первых египетских отцов-монахов на западной стороне церкви обращает на себя внимание фигура Стефана Нового (ум. 764), мученика эпохи иконоборчества, который держит в руках икону Богородицы типа Элеусы, т. е. Милостивой.
Прп. Неофит является автором свыше десяти сочинений, из которых наиболее известны «О бедствиях в Кипрской стране» и «Слово на шестоднев».
Интересен однокупольный храм, находящийся в монастыре к западу от пещеры, который построен в 1435 г. в честь Пресвятой Богородицы. В нем сохранились росписи храмовых сводов, выполненные в 1544 г. Много реликвий монастыря собрано в монастырском музее, расположенном в восточном корпусе.