Кирилл оказал покровительство и своему давнему протеже, священнику Георгию Кочеткову. Он тоже когда-то почитал митрополита Никодима (Ротова), учился в Ленинградской духовной академии, когда Кирилл (Гундяев) был там ректором, стал его приближенным, иподиаконом. Как раз тогда, по благословению своего наставника Кирилла, Кочетков начал переводить богослужебные тексты с церковно-славянского и греческого на современный русский язык, разрабатывать новые методы катехизации (обучения православным нормам).
В 1990-х он издал русифицированные тексты церковных служб, «Катехизис для катехизаторов», стал основателем и ректором Свято-Филаретовского инстутута, настоятелем двух храмов, где служили по-русски. Но духовенство и верующие миряне восприняли новшества очень встревоженно, считали их прямым продолжением «обновленчества». Особенно активно выступали против них архимандрит Тихон (Шевкунов), сектовед Александр Дворкин, протоиерей Дмитрий Смирнов. Вокруг общин «кочетковцев» происходили громкие скандалы. Алексий II временно временно запрещал Кочеткова в служении, для расследования его богословской деятельности была создана специальная комиссия, накопала обвинения сразу в нескольких ересях. Но Синодальная богословская комиссия под руководством митрополита Минского и Слуцкого Филарета (Вахрамеева) признала выводы тенденциозными и не утвердила, дело закрыли.
Кочетков остался ректором Свято-Филаретовского института, среди его покровителей был и митрополит Ювеналий (Поярков), определил его служить в Новодевичьем монастыре. А Кирилл вообще благоволил к нему, ввел в новый орган церковного управления, Межсоборное присутствие, иногда предоставлял служить в Храме Христа Спасителя. Правда, сам Патриарх на резкие реформы не пошел, продолжал служить на церковно-славянском. Но начал вставлять в службы русские переводы тех или иных чтений. Эту практику перенимали священники. Не в обязательном порядке, но кто-то счел ее полезной, кто-то желал угодить начальству, и она постепенно распространялась.
Для Церкви Патриарх задавал вроде бы твердый и решительный патриотический курс. На одном из приемов (в честь Святителя Петра Московского) он указывал: «Задача Русской Православной Церкви заключается в том, чтобы воспитывать человека, способного на жертву, на подвиг, на победу… Главное наше дело – молитва, но вокруг молитвы мы должны создавать активное поле жизнедеятельности, воспитывать людей, давать образование, являть примеры доброго отношения к людям через социальную деятельность». О Кирилле заговорили, как о рестравраторе идеи «Москва – Третий Рим», превращавшем Церковь в опору государственной власти. Тут и впрямь было похоже на «симфонию». Но… случился неожиданный «прокол».
В декабре 2011 года в России началась «Болотная революция». Абсолютно по тому же сценарию, как разыгрывались «Бульдозерная революция» в Югославии в 2000 году, «Революция роз» в Грузии в 2003 году, «Оранжевая революция» на Украине в 2004 году, «Революция тюльпанов» в Киргизии в 2005 году, «Сиреневая революция» в Молдове в 2009 году. После тех или иных выборов оппозиция объявляет их результаты сфальсифицированными, начинает массовые акции протеста, и они превращаются в «бессрочные». А дальше вмешиваются Евросоюз, США, требуют выполнить условия оппозиции. И… происходит государственный переворот.
В России было то же самое. Состоялись выборы в Думу и готовились президентские (с новой «рокировкой», после перерыва на пост главы государства опять выдвигалась кандидатура Путина). Но заранее, уже за месяц до думских выборов, стала распространяться информация, что после них начнутся протесты. Они и начались, причем объединились самые разнородные и, казалось бы, несоединимые силы! Коммунисты, «национал-большевики», «Авангард коммунистической молодежи», но они прекрасно состыковались с крайними националистами «Русскими», с самыми ярыми либералами – «Партией народной свободы» Немцова, Касьянова и Навального, с «Яблоком», с «секс-меньшинствами». И в результате получилось, что тон задавали не коммунисты, не националисты, а либералы!