Время от времени царю разрешалось встречаться со своей женой Александрой, или, как он ее называл, Алисой, а с сыном он мог встречаться, когда ему заблагорассудится. Однажды Александра Федоровна пришла в комнату царя в слезах и сказала: "Во всяком случае, необходимо, чтобы ты привел в порядок все свои бумаги и документы". После этого Николай писал всю ночь. Царь написал много писем, в том числе всем своим дочерям, брату Михаилу, дяде Николаю Николаевичу, генералу Догерту, герцогу Гендрикову, графу Олсуфьеву, принцу Ольденбургскому, графу Сумарокову-Эльстону, и многим другим. Он не запечатывал свои письма, так как вся его переписка контролировалась советской цензурой. Часто случалось, что его письма возвращались комиссаром гвардии с пометкой карандашом: "Пересылке не подлежит".
Много дней Николай Александрович не ел. Он падал ниц и только молился. Даже для человека, не обладавшего даром наблюдательности, было очевидно, что бывший царь сильно переживал и испытывал душевную тоску.
15 июля, поздно вечером, в комнате царя неожиданно появился комиссар гвардии, который объявил:
"Гражданин Николай Александрович Романов, вы проследуете со мной в Уральский окружной Совет рабочих, казачьих и красноармейских депутатов".
Царь спросил умоляющим тоном: "Скажите откровенно, вы ведете меня на расстрел?".
"Вы не должны бояться, до вашей смерти ничего не случится. Вас ждут на собрании", - улыбаясь, сказал комиссар.
Николай Александрович встал с постели, надел серую солдатскую блузу, сапоги, застегнул ремень и ушел с комиссаром. За дверью стояли два солдата, летты, с винтовками. Все трое окружили его и зачем-то стали обыскивать со всех сторон. Потом один из Летцев пошел вперед. Царя заставили идти за ним, рядом с комиссаром, а второй солдат пошел следом.
Николас не возвращался очень долго, часа два с половиной, не меньше. Он был очень бледен, его подбородок дрожал.
"Старик, дай мне воды", - сказал он.
Я сразу же принесла ему воды. Он опустошил большую чашку. "Что случилось?" спросил я.
"Они сообщили мне, что я буду расстрелян в течение трех часов".
На заседании Уральского окружного совета в присутствии царя был зачитан протокол судебного процесса. Он был подготовлен тайной организацией под названием "Ассоциация защиты родины и свободы". В нем говорилось, что раскрыт контрреволюционный заговор с целью подавить рабоче-крестьянскую революцию путем подстрекательства масс против Совета, обвиняя его во всех тяжелых последствиях, вызванных империализмом во всем мире - войне и резне, голоде, отсутствии работы, развале транспорта, наступлении немцев и т.д.
Далее в обвинительном заключении говорилось, что для достижения этой цели контрреволюционеры пытались объединить все несоветские политические партии, как социалистические, так и имперские. Доказательства, представленные на суде, показали, что сотрудники этой организации не смогли полностью осуществить свои намерения из-за расхождения во взглядах на тактику левых и правых партий. Из представленных доказательств следует, что во главе заговора стоял личный друг царя генерал Догерт.
Представленные против царя доказательства показывают, что в этой организации работали и такие представители, как герцог Крапоткин , полковник Генерального штаба Эхарт, инженер Ллинский и другие. Есть основания полагать, что Шавенпов также имел непосредственное отношение к этой организации, и что он должен был стать главой нового правительства в качестве военного диктатора.
Все эти лидеры создали очень сильный заговор. В московской боевой группе было 700 офицеров, которые затем были переведены в Самару, где они должны были ожидать подкрепления от союзников с целью создания Уральского фронта для отделения Великой России от Сибири. В дальнейшем, согласно предполагаемому заговору, когда проявятся результаты голода, все сочувствующие свержению советской власти будут мобилизованы для выступления против Германии.
Представленные доказательства свидетельствуют о том, что в заговоре принимали участие некоторые социалистические партии, в том числе правые эсеры и меньшевики, работавшие в полном согласии с конституционными демократами. Начальник штаба этой организации находился в прямой связи с Дутовым и Денекиным.
В показаниях говорилось, что за последние несколько дней был раскрыт новый заговор, целью которого было спасение бывшего царя из СССР с помощью Дутова.
Кроме того, на суде было доказано, что царь вел тайную переписку со своим личным другом, генералом Догертом, который убеждал царя быть готовым к освобождению.
Ввиду этих доказательств, а также в связи с затруднительным положением, вызванным решением Уральского окружного совета об эвакуации Екатеринбурга, бывшему царю было приказано безотлагательно подвергнуться казни, поскольку совет считал вредным и неоправданным продолжать держать его под охраной.
"Гражданин Николай Романов, - обратился советский председатель к бывшему царю, - сообщаю вам, что вам дается три часа на написание последнего приказа. Охранник, я прошу вас не упускать Николая Романова из виду".