24 марта 1918 года было опубликовано постановление ВЧК о создании местных чрезвычайных комиссий – губернских и уездных, и руководство террором централизуется, хотя ревтрибуналы с полномочиями ВЧК не только сохранились, но и дополнительно пополнились сотнями военных трибуналов, действовавших в Красной Армии. К весне 1919 года всю Советскую Россию покрывала сеть «чрезвычаек»: губернских, уездных, городских, волостных, железнодорожных, транспортных, были даже сельские и фабричные, а также разъездные карательные отряды и экспедиции. 8 сентября 1918 года официально были сформированы концентрационные лагеря, как предтеча фашистских лагерей смерти: с колючей проволокой и штатом охраны. Перед этим (в августе) Ленин в одной из директив указывает: «Провести массовый террор, сомнительных запереть в концентрационный лагерь!» Осенью 1918 года эти лагеря были рассчитаны на 35 тысяч человек. Но их пропускная способность была много выше, так как лагеря планировались прежде всего «для уничтожения буржуазии и контрреволюционеров»: заключенные массово погибали от болезней и голода (А. Буровский.
18 сентября 1918 года Г. Зиновьев на Петроградской партконференции заявил: «Мы должны повести за собой девяносто из ста миллионов человек, составляющих население Советской республики. Остальным нам нечего сказать. Их нужно ликвидировать». Член коллегии ЧК Мартин Лацис в статье от 1 ноября 1918 года писал: «Мы не ведем войны против отдельных лиц. Мы истребляем буржуазию как класс. Не ищите на следствии материалов и доказательств того, что обвиняемый действовал словом или делом против Советов. Первый вопрос, который вы должны ему предложить, – к какому классу он принадлежит, какого он происхождения, образования или профессии. Эти вопросы и должны решить судьбу обвиняемого. В этом – смысл и сущность красного террора».
На фронтах гражданской войны террор бушевал с невиданной силой. Казнили не только пленных, очень часто устраивались показательные расстрелы сотен заложников. Известны случаи, когда уговаривали целые подразделения белогвардейцев на сдачу с обещанием сохранить жизнь, и, обезоружив, так и ставили их строем под пулеметы. С окончанием гражданской войны Совнарком под руководством Ленина продолжает проводить жесткую политику по искоренению буржуазных, мелкобуржуазных и колеблющихся элементов среди гражданского населения. Считается, что гражданская война завершилась в 1920 году разгромом войск барона Врангеля в Крыму и окончанием японской интервенции на Дальнем Востоке. Однако продолжались восстания недовольных Советской властью крестьян в разных районах страны. 27 мая 1918 года создаются первые продовольственные отряды, вводится «военный коммунизм». Костяком продотрядов послужили 30 тысяч городских рабочих. Еще раньше, в марте того же года, для борьбы с повстанцами организуются ЧОНы – части особого назначения. Все эти отряды несли в деревню смерть и мучения. В ответ начались мятежи. В Тамбовской, Воронежской, Ярославской губерниях для подавления мятежей использовалась Рабоче-Крестьянская Красная Армия. Особенно упорными были выступления крестьян в Тамбовской губернии. Для подавления крестьянского восстания в 1921 году была специально сформирована Тамбовская армия во главе с командармом М. Тухачевским. Она насчитывала 45 тысяч бойцов, имела 768 пулеметов, 103 орудия, 5 бронепоездов, 21 бронеавтомобиль, 18 самолетов. Это все к вопросу о добром отношении Советской власти к народу, страдавшему под ярмом царского самодержавия, и к теории о построении социализма. В июле 1921 года эта армия применила против восставших боевые отравляющие вещества в виде хлора марки Е-56. Этому предшествовало соответствующее распоряжение полномочной комиссии ВЦИК по борьбе с бандитизмом.
В 1920 г. был организован концентрационный лагерь для пленных белогвардейцев на территории старинного монастыря на Соловецких островах, который в 1923 г. был преобразован в Соловецкий лагерь особого назначения (СЛОН). Это был полигон, где отрабатывались вопросы организации охраны заключенных, практика массовых расстрелов и технология захоронения трупов, обсуждалась возможность применения отравляющих газов для массового уничтожения людей; разрабатывались «нормы» питания заключенных и способы использования принудительного труда. Страшные данные о советской машине смерти приводит в своем труде «Россия, умытая кровью» Андрей Буровский (2011).