И что характерно, одним из главных инициаторов массовых репрессий в Эстонии в 1940 году был Сергей Кингисепп, сын Виктора Кингисеппа от первого брака. Он жестоко мстил тем, кто хоть как-то был причастен к расстрелу его отца.
По распоряжению советского представителя А. А. Жданова были проведены внеочередные выборы в эстонский парламент. По официальным данным, в них приняли участие 591 030 граждан (84 % от общего числа избирателей). В результате, за кандидатов «Союза трудового народа» (кандидатов других партий просто не регистрировали) проголосовали 93 % от числа голосовавших. Выборы прошли с большими нарушениями и фальсификациями.
21 июля первая сессия парламента нового созыва приняла решение об установлении в стране советской власти и образовании Эстонской Советской Социалистической Республики. А на следующий день была принята декларация о вступлении Эстонии в состав СССР.
После этого судьба бывшего «правящего триумвирата» сложилась трагически.
Президент Константин Пятс сложил свои полномочия 21 июля 1940 года. Он был арестован советскими властями и депортирован вместе с семьей в Уфу. В 1942 году его поместили в Казанскую тюремную психиатрическую больницу, а с декабря 1952 года Пятс находился в психиатрической больнице имени Литвинова в поселке Бурашево под Калинином (ныне это Тверская область). Там его поместили в отдельную палату и не подвергали медицинским процедурам. Проведя в этой больнице три года, 18 января 1956 года Константин Пятс скончался. В 1990 году его останки были найдены и перезахоронены на таллинском кладбище Метсакальмисту.
Главнокомандующий армией Йохан Лайдонер, который при начавшемся 17 июня 1940 года дополнительном вводе в Эстонию войск Красной Армии не только не отдал приказ открыть огонь, но по поручению Константина Пятса вел переговоры с советскими военными властями (с генералом армии К. А. Мерецковым), тоже был арестован и депортирован в Пензу. Потом его перевели в Кировскую тюрьму, затем – в Ивановскую. 16 апреля 1952 года Йохан Лайдонер был приговорен к 25 годам тюремного заключения за «активную контрреволюционную и антисоветскую деятельность». Его направили во Владимирский централ, где он и умер 13 марта 1953 года.
Министр внутренних дел Каарел Ээнпалу был арестован на своем хуторе. Он тоже был приговорен к длительному сроку лишения свободы и отправлен в Вятлаг, что в 371 км от Кирова. Там он заболел крупозным воспалением легких и скончался 27 января 1942 года.
Ряд историков утверждают, что в том, что произошло в Эстонии в 1939–1940 гг., виноваты сами члены «правящего триумвирата», что это был осознанный шаг эстонского руководства во главе с Пятсом. А все остальные просто не критиковали решения правительства, так как в тот момент в Эстонии царила диктатура. Впрочем, говорят, что генерал Лайдонер, в отличие от Пятса, был настроен более воинственно и полагал, что эстонская армия сможет противостоять советской на протяжении не менее двух месяцев. Однако ничего сделано не было.
Это была не только воля СССР, этого хотел и правящий режим в Эстонии <…> Пассивность и непровозглашение мобилизации не были вызваны отсутствием смелости или трусостью. Вопрос был в выборе Пятса и Лайдонера.
6 августа 1940 года сессия Верховного Совета СССР приняла постановление о принятии Эстонии в состав СССР.
Большинство зарубежных историков характеризует этот процесс как оккупацию и аннексию. Но, согласно официальной российской трактовке, ввод советских войск никак нельзя называть оккупацией, так как решение о вхождении прибалтийских стран в состав СССР в 1940 году было оформлено юридически вполне корректно.