Просто о ферментах. Почему они так полезны?

Помимо полипептидной цепи в состав активного центра ферментов могут входить различные вещества, необходимые для их функционирования. Условно их разделяют на коферменты и кофакторы, хоть и граница между ними достаточно условная. Более того, среди ученых – специалистов в области исследования ферментов (энзимологов) до сих пор ведутся дискуссии о точности того или иного определения. По наиболее распространенной версии, кофактор – это небелковая часть в ферменте, которая необходима для катализа. Если эта часть представляет собой органическую молекулу, например производное витамина (как уже упомянутый выше NAD+ – производное витамина В₃), ее называют еще коферментом. Под кофакторами часто подразумевают ионы металлов, например таких «экзотических», как молибдена или ванадия. В витаминно-минеральных комплексах присутствие таких микроэлементов связано именно с поддержанием активности соответствующих металл-зависимых ферментов.

Многие коферменты не «прикованы» к активному центру и могут свободно «приходить и уходить», выступая как бы вторым субстратом. Но если кофермент связан с активным центром сильными взаимодействиями (иногда даже настоящей полноценной химической связью), его удобно выделить специальным названием – простетическая группа, подчеркивая ее важность для существования сколь бы то ни было активного фермента.

Например, именно к простетическим группам относятся производные витамина В₂ – флавин мононуклеотид и флавин аденин динуклеотид. Белки, в состав которых входят данные простетические группы, имеют специальное название «флавопротеины», в человеческом организме их более 90! Многие ферменты с флавиновыми простетическими группами действуют в митохондриях клеток, обеспечивая энергетический баланс клеток.

Так, (электронпереносящий флавопротеин) – дегидрогеназа (или сокращенно ETF-дегидрогеназа) относится к классу оксидоредуктаз и помогает «посадить» электроны из матрикса (внутренности) митохондрий на специальный «корабль» – мембранный переносчик электронов убихинон (тоже кофермент, о нем поговорим ниже). Если в гене, кодирующем ETF-дегидрогеназу, случается поломка, развивается генетическое заболевание – глутаровая ацидимия второго типа, которая в легких случаях может приводить к низкому уровню глюкозы в крови, а в тяжелых – к грубым порокам развития.

Помимо флавинадениндинуклеотида ETF-дегидрогеназа содержит еще один кофактор – железосерные кластеры. Эти конструкции, состоящие из нескольких атомов от самого простого, в котором есть всего лишь 1 атом железа [1Fe – 0S] к наиболее распространенным кластерам на 4, 7 и 8 атомов – [2Fe – 2S], [3Fe – 4S], [4Fe – 4S] соответственно, вероятно, были первыми из всех известных коферментов и поддерживали жизнь на заре ее зарождения. Железосерные кластеры принимают участие во многих базовых биологических процессах. Помимо окислительно-восстановительных процессов в митохондриях, рассмотренных выше, кластеры задействованы в метаболизме ДНК. Многие ферменты, такие как праймазы, лигазы, полимеразы, нуждаются в железосерных кластерах для поддержания активности.

Возвращаясь к простетическим группам, отметим, что и производные витамина В₁ (а именно тиаминпирофосфат), и В₆ (пиридоксаль фосфат), и витамин В₇ (биотин) тоже выступают в энзимологии как простетические группы.

А как же известные коферменты, которые «приходят и уходят»? Один из самых известных коферментов – это, конечно, производное витамина В₃ никотинамид аденин динуклеотид, или сокращенно НАД. Это, без ложной скромности, один из центральных коферментов всего метаболизма, который задействован в сотнях процессов по всему организму, преимущественно в реакциях обмена углеводов, белков и жиров.

Другой значимый кофермент – кофермент А, производное витамина В₅ (пантотеновой кислоты), задействован в самом главном цикле метаболизма – цикле Креббса (мы его немного упоминали в главе про витамины). Кроме этого он задействован в биосинтезе жиров. Во всех случаях кофермент А помогает переносить кислотные остатки с одной молекулы на другую.

Благодаря массовой маркетинговой компании вы также можете быть знакомы с коэнзимом Q10 – или, если выражаться на русском языке, коферментом Q10. Ему приписывают буквально чудотворные средства при приеме в виде БАД, но на самом деле Q10 – лишь один из представителей большой группы коферментов убихинонов, которые присутствуют в митохондриях. Вы с ними уже частично познакомились при обсуждении флавопротеинов.