В конце ХVI – начале ХVII вв. слава этого монастыря сильно упрочилась и расширилась в большой мере благодаря жизни в нем уроженца села Кондакова Борисоглебской волости монаха-затворника Иринарха
(позже канонизированного и названного преподобным, умер в 1616 г.), обладавшего даром прозорливости. О своей судьбе сам Иринарх получил предсказания. Известный московский юродивый Иоанн, по прозвищу Большой Колпак говорил уроженцу Ростовской земли Иринарху, что будет на Россию чужеземное нашествие, но враги не причинят вреда Иринарху. Самому Иринарху было видение разорения Москвы врагами, он пришел к царю Василию Ивановичу Шуйскому и рассказал обо всем этом, но тот ничего существенного сделать не смог. Когда польские интервенты пришли покорять Россию, поляки более 2 лет стояли под стенами Борисоглебского монастыря, но не пытались его захватить. Они думали, что монастырь-крепость будет взята без боя, сдастся на милость врага, когда в Москве сядет на царский трон польский король или королевич. В это время монах-затворник Иринарх через окно своей кельи, обращенной к дороге от Ростова на Углич, призывал всех приходящих идти на защиту Отечества в ополчение К.М. Минина и Д.М. Пожарского, которые в то время собирались в Ярославле.Даже польские воеводы дивились смелости Иринарха и его уверенности в победе его соотечественников. Так, жестокий польский воевода, убивший многих русских монахов Микулинский, устроивший чуть ли не допрос Иринарху, был поражен его смелостью и отсутствием у него страха смерти. Он побоялся трогать этого монаха-затворника. Также беседовал с Иринархом воевода Ян Сапега, который в 1610 г. подивился бесстрашию этого монаха, гордо говорившего с врагами. Иринарх предсказал Сапеге гибель в России, если он не уйдет назад в Польшу (Сапега действительно был убит под Москвой). После разговора с Иринархом Сапега запретил полякам тревожить обитель, где жил старец, которого он назвал самым крепким и безбоязненным монахом из всех иноков, что он знал. Сапега подарил старцу деньги на свечи для монастыря и вручил знамя. Это было не военное знамя, а простая хоругвь, которую захватили войска Сапеги в каком-то разоренном ими монастыре. Эту хоругвь назвали «Охранное знамя Сапеги» (оно хранилось в Борисоглебском монастыре более 300 лет, в 1934 г. его передали Третьяковской галерее как уникальный памятник древнерусского шитья конца ХVI – ХVII вв.). Когда в 1612 г. Пожарский и Минин собрали ополчение, но остановились в Ярославле, не решаясь идти освобождать Москву от поляков, Иринарх прислал им, вождям ополчения, свое благословление и просфору (как это сделал в 1380 г. Сергий Радонежский для великого князя московского Дмитрия Ивановича – будущего Донского и его войска перед боем с ордынцами на поле Куликовом). После благословления и дара Иринарха русские войска без страха направились к Москве. По дороге к занятой поляками столице Пожарский и Минин заехали в Борисоглебский монастырь, чтобы лично у старца получить благословление на трудные, но нужные воинские подвиги, дела во благо Отечества и Православия. Национальные герои России князь Д.М. Пожарский и староста К.М. Минин всю жизнь особо благоволили к ростовскому Борисоглебскому монастырю. Как считали многие, судьбоносная миссия Пожарского и Минина оказалась успешной благодаря Промыслу Божьему, а также их поддержке и благословении на добрые дела во славу Отечества от старца-затворника Борисоглебского монастыря Иринарха, которого они всю свою жизнь особо почитали, как и ростовский монастырь, где он подвизался. Иринарх умер и был похоронен в Борисоглебском монастыре, в котором его мощи почивают под спудом и хранятся его вериги весом 154 кг.