В 1995 г. монастырь вернули Церкви. На месте разрушенного храма во имя преподобного Сергия Радонежского уже построили деревянную часовню. Сейчас в монастыре живут примерно 10 человек братии, работают воскресная школа и книжная лавка. Главные святыни возрожденного монастыря: чтимая икона преподобного Сергия Радонежского с частицей его святых мощей; икона святителя Агафангеля Исповедника, митрополита Ярославского и Ростовского с частицей его святых мощей (умер в 1928 г.). В 1 км от монастыря находится освященный источник, который раньше был соляным колодцем (поэтому и теперь его нередко называют целебным соляным источником).
В 18 км от Ростова Великого, в поселке Борисоглебский
(Борисоглеб), находится на берегу р. Устья Ростовский Борисоглебский мужской монастырь, основанный в 1363 г. по благословлению преподобного Сергия Радонежского, который около 1363 г. приходил в Ростов на богомолье, к мощам ростовских чудотворцев. Местные подвижники-пустынники Павел и Феодор (со временем они были канонизированы) попросили его указать место для постройки храма во имя святых мучеников Бориса и Глеба и последующего создания в их честь обители. Чуть позже Павлу и Феодору во сне явились князья Борис и Глеб, которые еще раз повторили слова Сергия Радонежского им о том, что Господь Бог, Пречистая Богородица и они сами будут помогать этому месту. Позже Павел и Феодор по указанию Сергия Радонежского построили похожие монастыри-крепости в других местах на севере Руси, в том числе на Белом озере. К старости они вернулись в Борисоглебский монастырь, игуменствовали в нем, здесь умерли и были похоронены (могила их находится в соборе Бориса и Глеба, над ней поставлены сень и чеканное надгробие).В царский период Борисоглебский монастырь имел высокий статус в церковной и государственной жизни России, особенно в ХV, ХVI, ХVII вв. Он был всегда сильным и славным. В трудные периоды своей жизни именно в этом монастыре находил приют великий князь московский Василий II Васильевич (Темный, 1415–1462, в.к.м. с 1425). Именно в этом монастыре крестили сына Василия II – великого князя московского Ивана III (Великий, 1440–1505, в.к.м. с 1462). Каменный Борисоглебский монастырь-крепость был построен по велению сына Ивана III – великого князя московского Василия III (1479–1533, в.к.м. с 1505), особенно почитавшего этот монастырь (который до него был всего лишь рядовым деревянным сооружением, а не крепостью-кремлем). Исключительное отношение именно к этому монастырю было у сына Василия III – царя Ивана Грозного (1530–1584, в.к.м. и всея Руси с 1533 г., царь с 1547 г.). Иван Грозный особо чтил Борисоглебский монастырь, он приезжал сюда 3 раза. Иван Грозный допускал, что со временем он оставит царский трон, уйдет в этот монастырь, станет монахом. Московские князья считали Борисоглебский монастырь своим; вот почему на столбах центрального въезда вылеплен первый герб московских государей. Особенно щедрые вклады в этот монастырь делал Иван Грозный, который внес сюда 15 вкладов за своих 5 жен и за убитого им сына Ивана, а также и за других жертв своего гнева. Правда потом Иван Грозный сделал Борисоглебский монастырь местом ссылки для неугодных ему людей, которых насильно постригали в монахи, но их земли и другие богатства отдавали именно этому монастырю. Неудивительно, что Борисоглебский монастырь был очень богатым. Он имел 360 сел, деревень, пустошей, 22 тысячи десятин земли, 7 тысяч крепостных крестьян, монопольное право на рыбную ловлю в реках и озерах своих волостей. Борисоглебскому монастырю подчинялись (были ему подведомственными) 3 монастыря: Никольский, Ковженский и Троицкий. Когда династия Рюриковичей пресеклась, Борисоглебский монастырь сохранил свой особый статус. Вот почему в 1613 г. под Утвердительной грамотой об избрании на Российский престол царем Михаила Федоровича Романова (1596–1645, царь с 1613) среди других важных персон свою подпись поставил «из Ростова Борисоглебский игумен Петр».