Во внутренней части храма была установлена бронзовая статуя Аполлона с маленькой фигуркой оленя в одной руке, и луком в другой (точнее — не луком, а фрагментом его центральной части в руке бога). Автором статуи считался скульптор Канак из полиса Сикион (северо-восток Пелопоннеса), живший в конце 6 в. до н. э. Изображения этой скульптуры можно видеть на монетах города Милета того периода. Канак был весьма прославленным скульптором в тогдашнем греческом мире, автором большого числа скульптур из бронзы, золота, мрамора, дерева, слоновой кости. В Британском музее есть экспонат под длинным номером 1824,0405.1. Считается, что это копия статуи Канака, которая стояла в старом храме Аполлона в Дидиме.
Если в Дельфах паломники задавали свои вопросы оракулу устно, то здесь они были обязаны подать свои вопросы только в письменной форме. Собрав эти вопросы, главный жрец, происходивший обязательно из рода Бранхидов, пройдя через процедуру поста и очищения, садился возле священного источника и, войдя в транс, издавал звуки, которые другие жрецы из семьи Бранхидов потом излагали в качестве связанного текста в стихотворной форме. Как и в случае с Дельфийским оракулом, Дидимейский оракул чаще всего давал весьма расплывчатые, двусмысленные ответы на заданные вопросы, избегая, таким образом, ответственности за возможные неудачи тех, кто следовал полученным ответам.
После разгрома Крёза быстро усилившаяся Персидская держава подчинила себе греческие города Малой Азии. Установленные ею порядки, прежде всего большие налоги, вызывали растущее недовольство греческих полисов региона. И в 499 г до н. э. началось Ионийское восстание, возглавляемое Милетом. Более подробно я рассказал о нем в главе, посвященной Милету.
После поражения восстания, падения и разорения Милета персидские войска пришли и в Дидиму. Они разрушили храм и увезли статую Аполлона в Эктабану, одну из тогдашних столиц Персии. Семья Бранхидов сразу сдалась на милость победителей, передала им хранившиеся в храме значительные сокровища и перешла на службу к победителям, перебравшись в персидскую провинцию Согдиана, располагавшуюся в междуречье Амударьи и Сырдарьи. Сегодня эта территория разделена между Узбекистаном и Таджикистаном.
После такого разгрома святилище пришло в упадок. Священный источник пересох, а об оракуле перестали вспоминать.
В таком запустении Дидима пребывала 150 лет — до самого приходя сюда Александра Македонского. После освобождения Милета от персов, в 334 г. до н. э., он прибыл в Дидиму, чтобы лично подтвердить священность и значимость этого места, распорядившись построить здесь новый храм, значительно больше старого. Новый храм, по его замыслу, должен был стать грандиозным сооружением, увековечивающим величие греков и его самого. Колоннада нового храма должны была насчитывать 120 колонн, диаметром более 2 м и более 20 м высотой каждая.
Священный источник вдруг наполнился водой, а лавровые деревья дружно зазеленели. Появившийся здесь новый оракул провозгласил Александра сыном верховного греческого бога Зевса и предсказал ему победу над персидским царем Дарием III под Гавгамелами. Такую победу, ставшую решающей в войне, Александр действительно одержал, в октябре 331 г до н. э. Правда, до этого, в ноябре 331 г. до н. э. он разгромил персидскую армию в битве при Иссе. Предвидел ли оракул это сражение, и какой прогноз он дал в отношении него, история умалчивает.
Александр оказался злопамятным. Окончательно сокрушив Персидское царство, он добрался и до семьи Бранхидов. По его приказу все члены семьи, мужского пола, несмотря на то, что с момента их бегства к персам прошло более 150 лет, были казнены, а женщины были проданы в рабство.
Помня о предательстве семьи Бранхидов, святилище стало работать по новым правилам. Теперь управление им было отдано не одной какой-то семье, пусть даже с заявляемым родством с самим Аполлоном, а городу Милету, который каждый год назначал главного жреца.
В 330 г. до н. э., уже после смерти Александра, Селевк Никатор, один из его командиров, ставший наследником большого куска империи Александра, передал святилищу бронзовую статую Аполлона, увезенную из святилища персами после подавления Ионийского восстания. Она была торжественно установлена на старом месте, в центральном дворе храмового комплекса. Основавший свое государство — царство Селевкидов, Никатор предоставил святилищу щедрую финансовую помощь, а его наследники продолжили поддерживать авторитет этого места. Жаждущие получить совет оракула вновь потекли сюда широким потоком. А со 2 в. до н. э. Дидима стала местом всегреческого праздника в честь Аполлона.