С началом гражданских войн между Цезарем и Помпеем всё государство, вместе со всеми своими спецслужбами, разделилось на два враждебных лагеря, один из которых возглавил Цезарь, а другой — Помпей. Подчинённые им разведывательные службы опирались уже не только на их деньги и связи, но на государственную власть и армию. Соперничать с ними не мог уже никто — римские вельможи могли лишь выбирать: примкнуть ли им к Цезарю или к Помпею. После гибели Гнея Помпея «Великого» свои собственные службы попытались организовать его сторонники в Африке и Испании, но после того, как в марте 45 г. до н. э. Цезарь добился окончательной победы в гражданской войне, на всей подвластной Риму территории установилось полное единовластие, правда, просуществовало это единовластие только год.
В марте 44 г. до н. э., после убийства Юлия Цезаря, централизованная система управления разведывательными, контрразведывательными и полицейскими структурами Римского государства рухнула. Каждая из вновь вступивших тогда в борьбу группировок принялась создавать собственные службы и устанавливать контроль над сохранившимися государственными структурами, а с началом новой гражданской войны в 44 г. до н. э. Римская держава практически разделилась на несколько враждебных регионов. Все борющиеся стороны формально признавали столицей Рим, а высшими законодательными органами римский сенат и народное собрание, однако группировка, терявшая контроль над Римом, тут же объявляла тех, кто устанавливал свой контроль над столицей, узурпаторами. Поэтому установление контроля над Римом отнюдь не означало, что контролируются все спецслужбы по всей стране.
К концу 43 г. до н. э., когда в Риме был установлен Второй триумират, наиболее мощными были спецслужбы, подчинённые триумвирам Октавиану, Марку Антонию и Марку Лепиду, но они прочно контролировали лишь Италию, Галлию и Испанию, и им вряд ли уступали спецслужбы сторонников Республики во главе с Гаем Кассием и Марком Брутом, контролировавшими все азиатские владения Рима и значительную часть Балканского полуострова. Однако этим перечень спецслужб, боровшихся за власть на территории Римской державы, далеко не исчерпывался, потому что вдобавок к этому свои собственные службы имел захвативший Сицилию и опустошавший Италию пиратскими налётами сын Гнея Помпея «Великого», Секст Помпей, а кроме того, никому не желали подчиняться и воевали друг с другом наместники провинций Старая Африка и Новая Африка.
Поражение войск Марка Брута и Гая Кассия осенью 42 г. до н. э. в битве при Филиппах привело к тому, что к концу года вся власть в римских владениях, за исключением Сицилии, удерживаемой Секстом Помпеем, сконцентрировалась в руках триумвиров. Но каждый из триумвиров имел собственные спецслужбы на подвластной себе территории. Фактически в Римской державе образовалось сразу четыре государства, одно из которых возглавлял триумвир Октавиан, другое — триумвир Марк Антоний, третье — триумвир Марк Эмилий Лепид и четвёртое, непризнаваемое первыми тремя, — Секст Помпей. Спецслужбы триумвиров сотрудничали друг с другом, но ни в коем случае не подчинялись одна другой и порою даже соперничали. На короткое время собственные спецслужбы удалось создать также Луцию Антонию (брату триумвира Марка Антония) и Фульвии (жене Марка Антония), развязавшим в 41 г. до н. э. Перузийскую войну против Октавиана и Марка Эмилия Лепида под лозунгами восстановления Республики, однако уже в начале следующего года Октавиан и поддержавший его Марк Эмилий Лепид сумели заставить Луция Антония капитулировать, а Фуль-вия бежала из Италии. Происшедшее после Перузийской войны перераспределение провинций между триумвирами усилило Октавиана, но страна по-прежнему была разделена на четыре части. В 36 г. до н. э., когда Октавиану удалось захватить владения Секста Помпея и Марка Эмилия Лепида, в Римской державе осталось две системы спецслужб, одна из которых подчинялась Октавиану, а другая — Марку Антонию. Оба режима считались неотъемлемыми частями Рима, оба признавали главенство римского сената. Однако до полного объединения страны было ещё далеко. Союз Октавиана и Марка Антония становился всё более и более формальным. Если Октавиан опирался на Рим и Италию, то Марк Антоний всё больше действовал в интересах Египта. Назначения консулов производились римским сенатом по взаимной договорённости между триумвирами, назначения наместников производили сами триумвиры на подвластных им территориях, но в то время как Октавиан, будучи триумвиром, тщательно придерживался всех внешних атрибутов прежнего республиканского правления, режим Марка Антония всё больше и больше начинал напоминать правление эллинистических царей. Это начало проявляться и в одежде Марка Антония, и в его поступках. Дело дошло до того, что в 34 г. до н. э. Марк Антоний даровал свои детям от Клеопатры царские титулы. Это был открытый отход от традиций Республики, много лет внушавшей гражданам отвращение к царской власти.