Во время гражданской войны 87 г. до н. э. Остию разграбили войска полководца Гая Мария, а двадцать лет спустя гаванью и всем находившимся в ней флотом овладели пираты. В 63 г. до н. э. Цицерон начинает строительство новой городской стены, которую заканчивают через пять лет. В 49 г. до н. э. Остия получает самоуправление. Во главе города становятся два местных аристократа: дуумвиры. В конце века, во времена Октавиана Августа, в Остии появляются театр и акведук; горожане обустраивают форум. В 42 г. н. э. севернее старой гавани император Клавдий начинает строительство нового порта (искусственного), соединенного каналом с Тибром; он же учреждает вместо квесторской новую чиновничью должность: прокуратор по продовольствию, который занимался всеми вопросами торговли зерном. При императоре Траяне была построена еще одна гавань (106–113 гг.). Порт процветал, и при императоре Адриане в Остии велось масштабное строительство. О возросшем значении города может свидетельствовать хотя бы такой факт: дважды Адриан брал управление Остией в свои руки.
Имперский кризис III в. отразился и на Остии. Город обезлюдел и перешел под управление портового прокуратора по продовольствию. Экономическая жизнь города ограничивалась почти исключительно портом. Константин Великий разделил административно порт и город. Последний стал называться Цивитас Флавия Константиниана.
Город начал быстро расстраиваться, причем часто при возведении новых зданий использовали старинный строительный материал. При Константине в Остии была построена базилика, ставшая местопребыванием епископа. И пока к причалам порта приставали тяжелые триремы, груженные зерном, город постепенно становился центром роскошного отдыха богачей.
Но новый расцвет Остии был недолгим. В роковом для империи V в. город снова обезлюдел; перестал функционировать даже акведук. В 537 г., когда Остию осадили готы, немногочисленные жители укрылись в театре, преобразованном в крепость. Войска византийского полководца Велизария защитили тогда город, но подняться на прежний уровень Остии уже не удалось. Окончательный удар античному городу нанесли сарацины, разграбившие Остию в IX в.
Уцелевшие после набега мусульман горожане переселились на новое место, в город Грегориополь, названный в честь папы Григория IV. При его строительстве использовался мрамор, взятый на остийских виллах.
В XIV в. кардинал Джулиано делла Ровере выстроил на окраине Грегориополя укрепленный замок, который должен был защищать речной путь в Рим, но в 1557 г., после крупного наводнения, русло Тибра изменило свое положение, и крепость стала ненужной. Остия была прочно забыта.
Первые археологические раскопки античного города-порта провел в 1801–1805 гг. Джузеппе Петрини; полвека спустя их продолжили Пьетро Эрколе и Карло Лудовико Висконти.
Более интенсивные исследования были проведены в ХХ веке, начиная с 1907 г. (Данте Вальери, которого сменил Гуидо Кальца). Особенно интенсивными раскопки были в 1938–1942 гг.
В середине ХХ столетия археологическая зона Остии была разделена на пять секторов, самым важным из которых, пожалуй, является первый, примыкающий с юга к Тибру.
На раскопках античной Остии можно увидеть фрагменты городских стен IV в. до н. э. (толщиной более 1,5 м) и I в. до н. э. (толщиной до 2 м), остатки трех городских ворот: Порта-Романа, Порта-Лаурентина и Порта-Марина (названия современные), развалины форума с Капитолием Адриана и храмом Рима и Августа, курией и базиликой (все тоже, конечно, в развалинах); так называемый «Форум героической статуи»; так называемый Круглый храм; театр, термы Форума и термы Нептуна, а также остатки античных городских жилищ.
Возле античного театра, на месте мучений епископа Кириака, в раннем Средневековье была возведена скромная часовня.
Лидо-ди-Остия
В конце XIX в. итальянское правительство приступило к благоустройству земель между столицей объединенной Италии и тирренским побережьем. Прежде всего необходимо было провести большой объем мелиорационных работ. Для осуществления этой амбициозной программы в 1884 г. в районе античной Остии расселили батраков из коммуны Равенна (область Романья) вместе с семьями. Безземельные переселенцы организовали первый в Италии кооператив батраков, сумевший добиться от правительства определенных экономических преференций.
Мелиорационные работы, состоявшие главным образом в откачке воды и прорытии каналов, продолжались семь лет. По окончании работ большинство из двух с половиной тысяч семей кооператоров остались близ древнего города. Официально это селение называется Лидо-ди-Остия, но сами жители, многие из которых продолжают говорить на романском диалекте, да и большинство римлян предпочитают называть разросшийся поселок просто Остией. В наши дни на одной из улиц Остии (виале дей Романьоли) высится памятник основателям переселенческого кооператива.