Рим немедленно отправил посольства в греческие государства, чтобы убедить их в продолжении своей поддержки. Войска были посланы в Эпир для подготовки нападения на Македонию. Римляне дальновидно утвердились сами в Греции в удачное время для проведения военных действий, таким образом, хитрость состояла в том, чтобы задержать Персея. Легат с консульским рангом по имени Квинт Марий Филипп прибыл к Персею, предложив более убедительно доказать Риму, что Эвмен ошибся в своих обвинениях. Персею было сказано, что переговоры могут состояться. Эта тактика затягивания успешно привела к перемирию в течение зимы, дав римлянам необходимое время для подготовки своих войск к войне в Греции на следующий год. Затем Филипп предпринял действия, чтобы быть уверенным, что никто из союза эллинистических государств не окажет поддержки Персею. Между тем в 171 г. до н.э. римская армия высадилась на берегу Иллирии под командованием консула Лициния Красса.
Когда война была объявлена, Красс потерпел поражение в Фессалии. Он был в ярости и обвинил в недостаточной помощи этолийцев. Римляне начали разграблять не только враждебные города Греции, но и союзников, посчитав это данью за неоказанную поддержку, причиной чего, как понимал Красс, стал провал в Фессалии. Это сделало римлян чрезвычайно непопулярными среди своих былых союзников в Греции. Римские солдаты в это время вели себя недисциплинированно и бесконтрольно - сказалось отсутствие эффективной реформы в течение предыдущих лет. Греческие города были разрушены, а жители проданы в рабство. Кажется, больше усилий было потрачено на разграбление городов, чем на стратегическое предотвращение вторжения со стороны Македонии.
В течение нескольких последующих лет война превратилась в серию набегов на города и недовольство безнравственными римскими консулами, пока наконец в 168 г. до н.э. не был назначен консул, который смог восстановить, казалось, утраченную дисциплину в ставшей необузданной римской армии. Луций Эмилий Павел, новый консул, быстро привел армию в порядок, реорганизовав ее и усилив подготовку. Он собрал большое войско, которое двинулась на север, чтобы встретиться с македонянами в битве при Пидне 22 июня 168 г. до н.э.
Македоняне пополнили свои ряды после сокрушительного поражения при Киноскефалах в 197 г. до н.э., но они не отказались от фаланги, что снова стало причиной их гибели. Пересеченная местность на поле боя при Пидне сделала почти невозможными действия тесно сомкнутой фаланги, и македонская армия понесла огромные потери - около 25 000 убитыми. Персей бежал, но, не найдя союзников, готовых ради него противостоять Риму, был вынужден сдаться. Поощряя армию мстить тем греческим государствам, которые не помогли Риму в его борьбе против Македонии или тем, кто помогал македонянам, Павел, казалось, утратил контроль над дисциплиной, проявленной римской армией при ее организации. Тысячи людей были убиты или проданы в рабство, захвачены были огромные запасы золота и серебра.
Что касается Македонии, с тех пор как римляне доказали свою неспособность сохранить ее как единое царство, она распалась на четыре небольшие республики, ни одна из которых не могла оказывать помощь другим, они были также лишены права торговать друг с другом или заключать браки между жителями этих республик (commercium и conubium).