Не помогло даже то, что весной 1282 г. на Сицилии, где собирался огромный десантный флот анжуйцев против Константинополя, неожиданно вспыхнуло кровавое антифранцузское народное восстание, известное как «Сицилийская вечерня»: оно началось в Палермо, когда в пасхальный понедельник колокола звали к вечерней церковной службе. Ненавистные анжуйцы были перебиты и изгнаны с помощью сил короля Арагона Петра III. Субсидируемый потоком византийского золота, он нанес Карлу Анжуйскому спасительный для Ромейского царства удар в спину, после которого тот умер через три года сломленным человеком. Тем не менее, с юга Италии анжуйцы не убрались и вступили в продолжительные, изнурительные войны с королевским домом Арагона и византийцами.
Реакция не замедлила последовать. В правление сына Михаила, кроткого и очень набожного Андроника II Палеолога (1282–1328 гг.) противники унии были возвращены из ссылок и превозносились как мученики за Православие. Свобода Восточной Церкви больше не ущемлялась, влияние ее и особенно монашества выросли. Византийские обители и материально, и духовно вступили в свой золотой век. Иоанн XI Векк, главный поборник церковного единства греков и латинов, удалился в монастырь и отрекся от патриаршества. Тяжелый духовный кризис с виду был вроде бы преодолен. Константинопольский патриархат остался центром православного мира. Но и сменившие друг друга четыре последующих Патриарха (с 1282 по 1303 гг.) не смогли восстановить мир в Греческой Церкви. Один из них, Григорий Кипрский (1283–1289 гг.), светский человек, едва ли не силой втащенный Андроником II на патриарший трон, с горечью вспоминал в своей автобиографии: «…каждый предпочитал собственные удовольствия и почести божественной пользе, Церковь исполнилась смятения и бесчинств, управлять и распоряжаться там нравилось всем, а подчиняться канонам — никому, так что подтвердилась правота Платона: не каждому полезна свобода». Едва возродившись, Ромейское царство, несмотря на виртуозную дипломатию, входило в XIV в. в ухудшившихся внешних обстоятельствах, в предчувствии тяжелых испытаний, растеряв былые надежды.
Во внешней политике Андроник II тоже поменял ориентацию отца и вовсе перешел к глухой обороне. Военных способностей он не имел, полководцам не доверял, поэтому грохоту сражений этот высокообразованный император предпочитал занятия финансами, литературой, а высшие государственные посты, места советников предоставил людям сугубо гражданским. В их числе можно было найти таких знаменитых ученых-энциклопедистов, людей высоких интеллектуальных способностей как