Самое главное — распря довела и без того истощенную страну до совершенно плачевного состояния, открыла путь на территорию Ромейского царства болгарам, сербам, монголам и туркам, которые, не опасаясь отпора со стороны символической по численности армии, совершали свои опустошительные набеги на византийские земли. В результате некогда богатейшая византийская провинция — Фракия, особенно пригодная для выращивания зерна, была опустошена, многие деревни разграблены и сожжены. Ромеям пришлось вести здесь частые и кровопролитные войны. Еще более безуспешно они пытались вернуть свои былые позиции в практически уже утерянной Малой Азии, где под ударами турок-османов взывали о помощи значительные северные центры — Никея и Никомидия, отрезанные друг от друга. В силу этого Византия все более превращалась из Империи в малую европейскую державу Балканского полуострова, но и здесь ее теснили враги, прежде всех, крепнувшие за счет обильных серебряных рудников Ново Брдо сербы, легкомысленно не чувствовавшие общей нависшей над ними мусульманской опасности с Востока.
С победой Андроника III вся полнота власти оказалась в руках одного из самых видных представителей военной аристократии, могущественного фракийского магната Иоанна Кантакузина, с которым молодой император дружил с детских лет и которому безгранично доверял. Ведь, собственно, золото этого вельможи помогло Андронику Младшему победить в борьбе с его царственным дедом и облечься в вожделенную порфиру. Закадычный друг нового василевса получил титул великого доместика, или главнокомандующего, но все понимали, в чьих руках сосредоточилась реальная власть в стране.
С помощью Иоанна Кантакузина Андроник III, при всей том, что он тяготился царскими заботами и занятиями, все же проявил себя как богобоязненный, добросовестный и мудрый правитель. Он даже попытался реформировать судебную систему, ставшую притчей во языцах из-за своей хронической продажности. Созданная им централизованная высшая судебная коллегия из двух духовных и двух светских «вселенских судей ромеев», надзиравшими за всей судебной системой, проживет до последних дней Ромейского царства, хотя в условиях нараставшего ослабления связей с провинциями в разных местах, особенно на Балканах, со временем появятся свои, так сказать, местные вселенские судьи.
Внутреннее правление первых Палеологов характеризовалось противоречиями и конфликтом интересов государства, стремившегося к централизации, и аристократии, рвавшейся к власти, и на самом деле обладавшей ею, занимавшей особое, привилегированное положение.