Как только они поняли, насколько слабой была португальская власть, коммерчески подкованные голландцы решили попытаться захватить контроль над торговлей, для чего отправили в 1605 г. большой флот на «острова специй». «Острова Банда и Молуккские острова являются нашей главной целью, – объяснили директора компании своему адмиралу в регионе. – Мы рекомендуем, чтобы вы сильнее привязали эти острова к компании если не договором, тогда силой!» Голландцы изгнали испанцев и португальцев с Молуккских островов, приказали нескольким недавно прибывшим английским кораблям покинуть острова и таким образом захватили прямой контроль над торговлей гвоздикой. VOC затем приступила к безжалостному укреплению своей новой монополии, решив преуспеть в том, в чем португальцы потерпели неудачу. Производство гвоздики было сосредоточено на центральных островах Амбон и Серам, а чтобы оно было под более плотным контролем, древние рощи гвоздичных деревьев на других островах были выкорчеваны, сборщики гвоздики убиты, а их деревни сожжены.
Там, где было разрешено производство гвоздики, выращивание других специй было объявлено вне закона. Это делало местных жителей полностью зависимыми от голландцев, которые их «кормили». Голландцы продавали продукты питания по высокой цене, а покупали гвоздику по низкой; объем производства, понятно, снизился, побудив голландцев заказать посадку новых деревьев. Но к тому времени, когда деревья достигли зрелого возраста, предложение превысило спрос, и производителям было приказано опять рубить деревья. Последовал очередной цикл, когда голландцы пытались сбалансировать высокий спрос и низкое предложение из-за медленно растущих деревьев и нерадивых производителей. Выращивание гвоздики вне голландского контроля запрещалось под страхом смерти, а тайная торговля была подавлена.
Макасар, региональный торговый центр, где англичане, португальцы и китайцы покупали контрабандную гвоздику, был закрыт.Похожая история была на островах Банда – ближайшем источнике мускатного ореха. Первоначально голландцы убедили жителей подписать документы, по которым они обязались не продавать специи кому-либо еще. Но те продолжали делать это, потому что, возможно, не знали, что они подписали. В частности, они торговали с англичанами, которые основали базу на крошечном острове Рун, расположенном западнее основной группы архипелага. Попытка голландцев построить форт в Бандасе в 1609 г. спровоцировала спор с местными жителями, и группа во главе с голландским адмиралом, который пошел на переговоры, была уничтожена жителями Банды при поддержке англичан. Голландцы ответили захватом Банды – они построили там два форта и стали требовать от местных жителей подчиниться монополии. Деревни были сожжены, а жители убиты, изгнаны или проданы в рабство. Сельских вождей пытали, а затем обезглавили самурайские наемники, привезенные из Японии, где голландцы были единственными европейцами, которым было разрешено торговать. Затем острова были разделены на 68 участков, укомплектованных рабами и сданных в аренду бывшим сотрудникам VOC. Условия были жестокие – рабочих на ореховых плантациях убивали самыми изощренными способами за самые незначительные нарушения, но торговый поток самых ценных специй был теперь в руках голландцев.
Англичане согласились покинуть «острова специй» в 1624 г. и сосредоточиться на коммерческих возможностях в Китае и Индии, хотя голландцы позволили им сохранить суверенность Рун, где небольшой английский контингент продержался много лет. Этот крошечный клочок земли длиной в две мили и шириной менее полумили был первоначально взят англичанами в 1603 г., когда английский и шотландский престолы были объединены. Так что это был первый опыт британского колониального владения в любой точке мира и первый крошечный шаг к формированию Британской империи. В конце концов в 1667 г. Рун был оставлен голландцам на условиях Бредского соглашения. Это был один из многих мирных договоров, подписанных во время англо-голландских войн XVII и XVIII вв. В рамках сделки 1667 г. Британия получила небольшой остров в Северной Америке под названием Манхэттен.