1. Борьбе с униатским проектом автокефалии Киевской митрополии, продвигавшимся тогда «отцом историософской ереси украинства» и геноцида русских Подкарпатской Руси Львовским униатским митрополитом Андреем Шептицким и его агентурой из «Украинской Центральной рады» и «Союза освобождения Украины», финансировавшихся, как и ВКП(б), Германией и небезызвестным Парвусом. В противовес этому архиепископ Митрофан выступил с предложнием в противовес униатскому проекту украинской автокефалии ограничиться небольшой автономией для УПЦ, значительно меньшей, чем сейчас, и в противовес большевистской украинизации и поддержки раскола «УАПЦ» отменененной святым Патриархом Тихоном.
2. Архиепископ Митрофан вместе с архиепископом Антонием (Храповицким) становится на соборе ключевым ревнителем восстановления Патриаршества и ревнителем реабилитации идеолога воссоединения Великой, Малой и Белой Руси Патриарха Никона. Против восстановления Патриаршества было Временное правительство, его министр исповеданий А. Карташев, которые устраивали «епархиальные съезды», где свергали «реакционных» архиереев, устраивали «демократию» в монастырях и т. д. Идеолог восстановления Патриаршества в Русской Церкви митрополит Антоний (Храповицкий) был фактически арестован: его долго держали в Валаамском монастыре, можно скзать, под домашним арестом. Пока Антоний был в таком положении, борьбу за восстановление Патриаршества вели архиепископ Митрофан и Иларион (Троицкий), тогда только ставший молодым епископом и они противостояли компрадорскому антипатриархистскому «либеральному болоту». Противники восстановления Патриаршества, будущие организаторы обновленческого раскола, во главе с главным редактором «Церковнообщественного вестника» проф. Борисом Титлиновым на несколько месяцев парализовали восстановление Патриаршества и работу собора. А ведь митрополит Антоний предлагал сначала восстановить Патриаршество, избрать Патриарха и затем решить все актуальные вопросы. Если бы собор открылся раньше и Патриархом избрали бы митр. Антония (Храповицкого), то этот волевой миссионер свернул бы безбожным большевикам шеи и «октября» бы не произошло. Митрополит Антоний боролся за возрождение Патриаршества с начала XX в., и невосстановление Патриаршества — это роковая ошибка царской власти, которая и привела к «февралю», к падению Церкви и России.
Но, вопреки саботажу либералов-миссиофобов, Собор принял ряд важнейших решений, в их числе восстановление Патриаршества, которое было осуществлено уже после большевистского переворота Патриархом стал святитель Тихон, потому что набравший большинство при голосовании за кандидатуры Патриарха митрополит Антоний (Храповицкий) был бы немедленно расстрелян большевиками и по сути бескомпромиссный, но более дипломатичный св. Тихон был на тот момент безальтернативен.
Собор принял ряд важных постановлений по организации приходских общин, призвал всех православных христиан записываться в приходы. Это и сейчас необходимо, но, чтобы восстановить канонический территориальный принцип организации приходов, они должны быть созданы в каждом микрорайоне наших городов и в каждом селе.
Собор принял крайне актуальное Определение об отношении к светскому Российскому государству («Определение о правовом положении Православной Российской Церкви»), согласно которому его Глава и ключевые деятели должны быть православными.
Митрополит Антоний для того, чтобы переломить ситуацию на соборе в пользу восстановления Патриаршества, привез делегацию собора в Новоиерусалимский монастырь, где братия засвидетельствовала 143 засвидетельствованных случая молитвенной помощи оклеветанного агентурой Речи Посполитой идеолога воссоединения Великой, Малой и Белой России Патриарха Никона, и митр. Антоний переломил этим ситуацию в пользу восстановления Патриаршества. Сторонники митрополита Антония, такие как св. архиепископы Митрофан (Краснопольский) и Иларион (Троицкий), называли себя «православными патриархистами».