Началось все в 1984 году, когда архимандрит Нафанаил (Поспелов) проводил по монастырю экскурсию для работника Министерства связи Сергея Яковлевича Новикова с супругой. В Богом зданных пещерах Новиков рассказал, что во время войны он был разведчиком и однажды, завершая рейд по немецкой прифронтовой полосе, несколько дней скрывался в пещерах монастыря. Хлеб и воду им приносил какой-то монах. В присутствии благочинного монастыря игумена Тихона (Секретарёва) и эконома иеромонаха Филарета (Кольцова) С. Я. Новиков узнал на старой фотографии монаха, снабжавшего разведчиков едой и питьем, - это был старец иеросхимонах Симеон. 24 января 1989 года С. Я. Новиков прислал журналистке С. И. Галаевой письмо, где писал: «Прошло 45 лет, и мне трудно вспомнить подробности. Но факт оказания гостеприимства одним из служителей монастыря (как позже выяснилось, отцом Симеоном, о чем он скрыл от других служителей) весной ли, летом 1944 г., имел место. Группа разведчиков, возвращаясь с задания, несколько дней скрывалась в пещерах монастыря, о чем я рассказал одному из служителей в период посещения Псково-Печерского монастыря в 1984 году».
Однако интересно, что всего через год с небольшим, 14 мая 1990-го, давая показания прокуратуре в связи с готовившейся реабилитацией игумена Павла, С. Я. Новиков вспомнил уже совершенно другое. По его новой версии, он не скрывался несколько дней в пещерах монастыря, возвращаясь с боевого задания, а просто посетил их с экскурсией в начале октября 1944 года, когда Печоры уже были в глубоком тылу: «Осмотрев монастырь, в контакт с монахами мы не вступали, да и они особого интереса к нам не проявляли, проходя мимо нас молча. Подойдя к входу в пещеры, мы попросили одного из монахов пустить нас туда для осмотра. Это им было сделано. В пещере мы пробыли несколько часов, т. к. в это время начался длительный дождь, а желания промокнуть ни у кого не было. <...> После войны из представленных мне фотографий я опознал в монахе, открывавшем вход в пещеры, иеромонаха Симеона. <...> Знали ли другие монахи, в том числе и наместник монастыря игумен Павел, о пребывании группы в пещерах монастыря, мне не известно, да и это не имело значения в тот период времени, поскольку мы находились на освобожденной Советскими войсками территории». Эти показания бывшего разведчика хранятся в фонде А-21132 Государственного архива Псковской области и были опубликованы в 2013 году. С чем связано подобное изменение акцентов в воспоминаниях С. Я. Новикова, в точности сказать сложно. Однако можно предположить, что свои показания он изменил в связи с тем, что в 1990-м уже знал о судимости игумена Павла за сотрудничество с оккупантами и не хотел, чтобы его свидетельство поспособствовало его реабилитации. Таким образом, истинным является его первый рассказ - то есть советские разведчики действительно провели несколько дней в пещерах во время боевых действий под покровительством старца Симеона, действовавшего без ведома игумена и втайне от прочей братии.
Мы столь подробно остановились на небольшом (всего три года) отрезке из истории монастыря потому, что он наиболее ярко отражает сложные реалии ХХ века, в которых приходилось действовать обители. Безоговорочно оправдывать либо так же безоговорочно осуждать монастырские власти, вынужденные взаимодействовать с оккупантами, - дело публицистов. Мы же, руководствуясь заповедью «Не судите, да не судимы будете» (Мф. 7: 1), пытаемся разобраться в мотивах действий людей, находившихся в чудовищных обстоятельствах, не скрывая ни светлых, ни темных сторон.
...Между тем шли годы, линия фронта начала сдвигаться с востока на запад. 25 февраля 1944 года нацисты распорядились об упаковке самых ценных исторических предметов, хранившихся в монастырской ризнице, для «эвакуации». Никакого восторга этот приказ у наместника и братии не вызвал - монастырские святыни еще никогда не покидали пределов обители. Невольно «помогла» бомбежка Печор советскими самолетами 6 марта: одна из бомб попала в лестницу на Успенской площади, буквально в пяти метрах от ризницы. После этого было решено во избежание гибели бесценных предметов согласиться на их отправку в Ригу (о перевозке ценностей в Германию речь не шла). 18 марта четыре огромных ящика с сокровищами ризницы были вывезены в Латвию. В ночь с 31 марта на 1 апреля налет на Печоры повторился, но, к счастью, прямых попаданий в монастырские здания не было. Одна из бомб разорвалась на Успенской площади, от ее осколков в своей келии погиб прямо во время молитвы 72-летний схиепископ Макарий (Васильев, 1871-1944).