Недаром на Фамагусту в первую очередь позарились генуэзцы, когда королева Элеонора втянула их в кипрский конфликт с венецианцами и Лузиньянами. Началось все, скажем так, малообещающе в смысле войны – на коронации Петра Второго в Фамагусте (1372 г.) венецианцы заняли место по правую руку от короля, которое раньше принадлежало генуэзцам. Конфликт перешел в кровавую стычку на пиру, последовали генуэзские погромы, и все с попустительства короля; папа по ходатайству королевы-матери (Элеонора хочет воспользоваться случаем и устранить от власти братьев покойного мужа) вступается за генуэзцев. В итоге – война! Франки не смогли удержать город в 1373 году, и он стал яблоком раздора между тремя вышеперечисленными силами, в результате чего от постоянных осад начал приходить и разрушение. Далее Куглер пишет: «При… Петре Втором, который правил до 1382 года, началось падение небольшого государства. С гордыми итальянскими колониальными общинами королям Кипра уже до сих пор пришлось выдержать несколько неприятных столкновений, но теперь случился особенно тяжелый раздор с генуэзцами, которые наконец… присвоили себе Фамагусту, монополизировали для себя тамошнюю торговлю и совершенно сломили силу Кипрского государства тяжелыми военными контрибуциями, которые на него наложили. Король Петр Второй и его преемники много раз, но тщетно старались избавиться от жестоких оков, которые на них наложили генуэзцы. Несчастные войны отчасти с могущественной морской республикой, отчасти с египетскими султанами приводили их все в более и более стесненное положение. Кипрская государственная казна, наполненная некогда через край, вскоре совсем опустела, и блеск Фамагусты также быстро поблек, потому что генуэзцы были слишком слабы, чтобы с тем же оживлением продолжать торговлю [с половиной] мира, которая там процветала до их монопольного господства. Раздоры в королевском доме и враждебные столкновения между католическим и греческим населением острова довершили беду».
Впрочем, Фамагуста оказалась на деле вовсе не таким подарком, каким казалась, и генуэзцы оказались в ней меж трех огней – Лузиньянами, мамлюками-египтянами и турками, так что даже в мирные времена они чувствовали себя, как в осаде. Скромный гарнизон, вряд ли превышавший в лучшие времена 350–500 человек, к концу генуэзской оккупации достигал едва 200; крепость защищали порядка 50 бомбард. Одна плата военным и морякам (получавшим несравненно меньше) обходилась фамагустцам примерно в 150 000 золотых византинов в год. С поставкой продовольствия были проблемы, торговля быстро угасла из-за всеобщей изоляции; решили, как любое недальновидное правительство, сэкономить на воинах – гарнизон сократили, плату ему довели до 90 000 византинов; этим попытался воспользоваться король Иаков Второй, в 1441 г. штурмовавший Фамагусту с суши и моря, но безуспешно. Генуэзцы начали было шевелиться, генуэзский банк св. Георгия даже выпустил фамагустские акции на 10 000 лир, но все оказалось без толку, ибо, как подытоживает исследовательница кипрского Средневековья С.В. Близнюк в своей статье «Фамагуста начеку», «метрополия… не предприняла никаких реальных шагов… В последние годы пребывания генуэзцев в Фамагусте город явно не выполнял своей основной функции как крупнейший торговый центр Леванта. Следовательно, он не приносил ожидаемых доходов. В связи с этим правительство все меньше и меньше уделяет внимание его проблемам, бросив соотечественников в нем практически на произвол судьбы. Содержание Фамагусты стало слишком дорого обходиться казне».
В итоге на закате правления Лузиньянов король Иаков Второй в 1464 г. сумел-таки со второй попытки (первая была в 1463 г.) вернуть город, некогда фактически бывший второй столицей Лузиньянов, ведь именно в фамагустском соборе Св. Николая они венчались на царство как номинальные короли Иерусалима; в нем король-освободитель и был погребен. Ведь Фамагуста после уничтожения последних владений крестоносцев в Палестине (1291 г.) практически была приравнена к Иерусалиму по своему священному статусу, как пишет та же С.В. Близнюк в своей книге «Короли Кипра в эпоху Крестовых походов»: «После завоевания мамлюками Акры венчание кипрских королей иерусалимской короной стало проводиться в Фамагусте в соборе св. Николая. С 1291 г. Фамагуста, до сей поры являвшаяся простым епископством, стала своеобразным воплощением «святого города Иерусалима», его преемницей и символом. Фамагуста как бы становится столицей Иерусалимского королевства. Именно здесь, начиная с Гуго Четвертого (1324–1359) кипрские короли венчались иерусалимской короной (Гуго его и достроил