Арестованные участники операции давали в отношении Чанышева и Ходжамьярова очень краткие и правдивые показания, которым затем следователями придавался обличительный уклон и в которых переплетались явь с вымыслом. Например, показания Ушурбакиева Азиза, данные им 11 января 1938 года в записи следователя выглядят так: «В 1919 году в Джаркенте существовала тайная контрреволюционная организация, которая имела цель свержения советской власти путем вооруженного восстания мусульманского населения и поддержке атамана Дутова. В 1920 году Чанышев для переговоров с Дутовым ездил в Кульджу и предложил свои услуги. После переговоров с Дутовым Чанышев систематически посылал в Китай к Дутову с письмами Тынчерова Ханафия, а через Ходжамьярова направил две винтовки и два нагана. В 1921 году эта контрреволюционная организация была раскрыта, Чанышев и его братья арестованы, после чего Чанышеву было предложено убить Дутова, на что он согласился. Дутов был убит, а Чанышев овобожден от наказания».
Такой же характер носят и показания Байсымакова Мукая. Допрошенный 12 января 1938 года он показал: Ходжамьяров и Чанышев имели тесную связь с Дутовым. Хотели свергнуть советскую власть в Казахстане. Для этого Чанышев неоднократно посылал в Китай Ходжамьярова и Тынчерова с письмами к Дутову. Переправил ему две винтовки и два револьвера. Ходжамьяров привлекал его для переноски писем.
Были допрошены также Ушурбакиев Насыр и Тынчеров Ханафия. В основном они рассказывали о ходе операции против Дутова, об участниках операции не говорили.
Из протоколов допросов видно, что они были сварганены на основе извращения фактических событий, и действия Чанышева и Ходжамьярова преподносились как действия членов подпольной нацоналистической организации, а ни как негласных сотрудников чекистких органов, выполнявших их ответственное государственное задание. О том, что Чанышев и Ходжамьяров контактировали с атаманом Дутовым в рамках чекистской операции и убили его, в делах участников операции ни слова. Читая потоколы допросов, я физически ощущал, как следователи буквально вкладывали в уста совершенно неграмотных людей сварганенные ими сведения, заносили их в протоколы допросов, которые те, в силу своей элементарной грамотности, не могли даже прочесть.
Ходжамьяров же в отношении своих сотоварищей ничего, что могло бы повредить им, не сказал. Свою контрреволюционную и шпионскую деятельность признал, вредительскую – отрицал. Почему Ходжамьяров признал себя контрреволюционером – не знаю, что касается признания себя шпионом, то он считал себя таковым. Но не шпионом атамана Дутова или националистической организации, а шпионом чекистких органов. Полагаю, что дознаватель Елкин воспользовался неграмотностью Махмута и ввел его в забдуждение. Никаким контрреволюционером и шпионом Ходжамьяров, конечно, не был, а все его хозяйственные грехи базировались не на его вредительстве, а на малограмотности, личной некомпетентности и на подталкивании его действительными врагами советской власти к причинению неумышленного с его стороны вреда народному хозяйству.
17 апреля 1938 года Ходжамьяров был дактилоскопирован. На имеющейся в деле дактилоскопической карте – отпечатки удлиненных кистей рук, которыми убит атаман, четко просматриваются все линии и каппиляры. Видно, что карта сделана поднаторевшим в этом сотрудником.
К концу года (точной даты в деле нет) следствие было окончено и Ходжамьярову предъявлено обвинение.