По результатам ревизии в 1724 году подворное обложение было заменено подушной податью на всех мужчин податных сословий, которых оказалось пять с половиной миллионов. Подушную подать стали платить холопы и дворовые, ставшие просто крепостными. Утаенные от переписи один миллион крестьян были отобраны у вороватых помещиков и стали государственными, оставаясь лично свободными. Подушная подать составила 74 копейки и платилась до следующей ревизии-переписи со всех душ, включая несостоятельных, умерших, бежавших, нетрудоспособных. В 1725 году сбор подушной подати был поручен воеводам. Деньги тут же разворовали и сбор налогов опять был передан армии. С 1731 года подушную подать обязали платить помещиков. Неуплата налогов приняла колоссальные размеры и достигла более двух миллионов рублей. У помещиков-должников стали конфисковывать и продавать на аукционах. Несмотря ни на что во времена петровских реформ подушная подать стала главной в государственном бюджете. В 1724 году было собрано почти девять миллионов рублей. Русское общество разделилось на две большие группы — податную и служилую. Дворяне и духовенство подушную подать не платили. Налоги платили те, кто не служил государству.
Налоги в городах собирали бурмистры, избираемые купцами и посадскими людьми. Благодаря этому городское население выводилось из-под власти воевод.
В петровское время в России еще не было банковской системы. В Москве деньги хранились в Главной казенной палате, подчинявшейся Петру.
В 1711 году для контроля за сбором налогов и финансами были введены должности казнокрадов и взяточников. Они должны были тайно наблюдать за государственными служащими. Им полагалась треть от выявленных хищений. Пойманных казнокрадов ссылали, сажали в тюрьмы, казнили. За казнокрадство, сопоставимое с расходами Петра на Северную войну был повешен сибирский губернатор князь М. Гагарин. Казнили и фискалов, бравших взятки с откупавшихся чиновников.
Контролировать страну Петру помогали специальные службы, занимавшиеся политическим сыском. Делами «по слову и делу государеву» занимался Преображенский приказ. Часть его архивов сохранились.
Приведенного под караулом человека расспрашивали в тот же день. Дело разъяснялось показаниями караульных, задержанных, свидетелей. Глава приказа князь-кесарь Ф. Ромодановский объявлял свое решение — отпустить, оштрафовать, бить батогами, продолжить расследование.
Преображенский приказ кроме политических занимался и уголовными преступлениями — убийствами, воровством, мошенничеством, грабежами, кражами лошадей, колдовством, староверами.
В феврале 1718 года для проведения следствия по делу царевича Алексея Петр создал Тайную канцелярию, располагавшуюся в Петропавловской крепости Петербурга. Позже к ней из Преображенского приказа перешли следствие и суд по важнейшим политическим делам. В мае 1725 года Тайная канцелярия была закрыта и дела опять переданы в Преображенский приказ, действовавший до 1729 года.
Одной из основных причин войны со Швецией был возврат балтийского побережья с гаванями, удобными для развития торговли с Европой. В конце царствования Петра внешнеторговый оборот составлял половину государственного бюджета и сравнялся с бюджетом 1700 года. К 1714 году Россия имела семь портов на Балтийском море — Ригу, Ревель, Нарву, Пернов, Выборг, Санкт-Петербург и Кронштадт.
Желание Петра сосредоточить морскую европейскую торговлю не в дальнем беломорском Архангельске, а в удобном балтийском Петербурге неожиданно столкнулось с противодействием. Архангельскую торговлю прочно контролировали голландцы, создавшие там удобную инфраструктуру. Московские купцы привыкли к северодвинской дороге из центра России до Архангельска. То, что порт действовал только два месяца в навигацию, их не особенно беспокоило. Петру стали врать, что переводом торговли из Архангельска в Петербург он разорит московское купечество. Царь, которого было невозможно обмануть, увеличил пошлины на разгружаемые в Архангельске иностранные товары, и почти снял их на товары, привозимые в Петербург. Восемь лет Петр совершал торговый переворот и как всегда добился своего. Елавным внешнеторговым портом стал Санкт-Петербург, в котором в навигацию 1720 года приняли более сотни судов из Европы. В 1725 году в российских балтийских портах разгрузили тысячу иностранных торговых судов. Вывоз русских товаров превысил ввоз в два раза.
Извилистая дорога из Петербурга в Москву протянулась на 750 верст и могла использоваться только морозной зимой и жарким летом. В осенней и весенней грязи и по поломанным мостам даже послы добирались из Москвы в Петербург более месяца. Петр попытался построить новую хорошую дорогу, но в ста верстах от Петербурга прочно увяз в новгородских болотах.