Доход от сдачи внаем квартир и помещений в Литейном доме составлял немалую сумму. Так, по сведениям из домовой книги 1904 года, женская гимназия Е.Н. Стеблин-Каменской занимала 16 помещений на четвертом этаже этого дома и платила домовладельцу 3600 рублей в год, аренда квартиры начальницы гимназии из шести комнат на пятом этаже стоила еще 1080 рублей.
Некоторые квартиры предоставлялись жильцам бесплатно. Так, Сергей Александрович Жемчужников, семейный врач графа С.Д. Шереметева, занимал квартиру из шести комнат на третьем этаже Литейного дома, стоимость аренды которой составляла 1320 рублей в год. Эдуард Николаевич Кантемиров, казначей Общества любителей древней письменности и член Совета Странноприимного дома, занимал квартиру из шести комнат на третьем этаже стоимостью 1500 рублей в год. А.А. Зост, служащий Главной конторы, жил в квартире из трех комнат на четвертом этаже, окнами во двор, аренда ее стоила бы 480 рублей в год.
Помещения магазинов в Литейном доме нанимали различные торговцы. По данным домовой книги за 1902 год, здесь, например, находились музыкальный магазин Д.А. Александрова (арендная плата составляла 1620 рублей в год), магазин белья Я.Р. Эммануил-Жуховецкого (1620 рублей в год), магазин виноторговли графа Шереметева (600 рублей в год), цветочный магазин Фрейндлиха (3133 рубля), магазин швейных машин компании Зингер (1800 рублей), магазин кондитерских товаров Блинкейна и Робинсона (1800 рублей), аптекарский и парфюмерный магазин Герша (1740 рублей), часовой магазин А.Е. Трахтенберга с квартирой (1200 рублей), магазин ружей и охотничьих принадлежностей купца 2-й гильдии И.И. Чижова (1560 рублей), книжный магазин Л.Ф. Мелина (1500 рублей), корсетный магазин Я.Л. Травина с квартирой (1800 рублей). Домовые книги дают возможность увидеть также, как росли цены на недвижимость в столице. Так, в 1910 году аренда помещения магазина виноторговли графа Шереметева стоила уже 1000 рублей, а помещения цветочного магазина Фрейндлиха – 4036 рублей.
Арендная плата за театральный зал и примыкающих к нему семи квартир в 1910 году приносила владельцу 12 тысяч рублей.
К сожалению, автор не располагает аналогичными сведениями о доходах, получаемых за аренду помещений в Шереметевском пассаже на Литейном, 53.
Фонтанный дом был дорог графу Сергею Дмитриевичу по многим причинам. В первую очередь – воспоминаниями о своем детстве, о родителях. В записках о годах своего детства, которые он писал для детей и внуков, он рассказывал о том, что ему запомнилось наиболее ярко. Так, он вспоминал о библиотеке своей матери: «…Винтовая лестница… вела в три смежные комнаты нижнего этажа, примыкающие к церковному подъезду… Первая комната была в два окна. В ней книг не было, а были расставлены в порядке дорогие исторические и семейные предметы. Тут в красном сафьяновом ларце лежали золотые ключи Риги и медаль, выбитая в память основания Странноприимного дома… В деревянном стеклянном шкафу расставлены были мелкие вещи, между ними бокал, из которого пил Император Николай шампанское на крестинах брата Николая. В комнате помещалось седло Карла XII, взятое после Полтавы, и больших размеров магнит, который особенно меня привлекал. В окнах всей библиотеки размещалась богатая нумизматическая коллекция – множество редких золотых петровских монет и медалей». Он вспоминал об убранстве кабинета своего отца на втором этаже в северном крыле дома. В нем размещалась библиотека с изданиями XVIII века, редкими гравюрами, миниатюрами, собранными в основном его дедом графом Николаем Петровичем.
Однако для графа Сергея Дмитриевича Фонтанный дом являлся не только домом его детства. Став взрослым, зрелым человеком, он осознал историческое значение своего родового гнезда и тех реликвий, которые здесь хранились. Он бережно сохранял то, что здесь находилось, и его усилиями Фонтанный дом превратился в фамильный музей.
Он сосредоточил здесь родовой архив Шереметевых, поскольку вполне осознавал важную роль своих предков в отечественной истории. В 1874 году, после раздела отцовских имений, он начал перевозить сюда архивы из дома на Воздвиженке в Москве, из некоторых вотчинных контор. Для размещения архива оборудовали четыре комнаты в первом этаже северного корпуса, рядом с его рабочим кабинетом. В архиве находились документы, относящиеся прежде всего к графской линии рода, начиная от фельдмаршала: документы на право владения имениями, о службах и наградах членов рода, деловая и личная переписка нескольких поколений графов Шереметевых, включая членов семьи графа Сергея Дмитриевича, отчеты управляющих и контор многочисленных имений. В этом архиве имеются документы и более раннего времени – XVII и даже XVI столетий. Здесь же сосредотачивались документы относительно строительства, ремонтов и убранства Фонтанного дома в разные периоды его существования.