Сегодня правовые отношения государства и церкви развиваются очень своеобразно. Многие исследователи отмечают расхождения между статьями Конституции РФ и тем, что происходит в действительности («Правовой статус Русской Православной Церкви в современном российском государстве» https://studbooks.net / 1080255/ pravo / pravovoy-status-russkoy-pravoslavnoy-tserkvi-sovremennom-rossiyskom-gosudarstve).
Например, в ст.14 Конституции РФ утверждается, что «РФ – светское государство. Никакая религия не может устанавливаться в качестве государственной или обязательной. Религиозные объединения отделены от государства и равны перед законом», хотя на самом деле особое место среди религиозных объединений занимает Русская православная церковь Московского патриархата. Она даже заключила договоры о сотрудничестве и взаимопомощи с Министерствами образования, обороны, внутренних дел. Бывший министр образования В.М.Филлипов привлек РПЦ к экспертизе «духовно-просветительских программ, проектов, учебной литературы» и пояснил, что эта экспертиза «призвана освободить государственные образовательные программы, учебники и учебные пособия от проявлений воинствующего атеизма» (М.Г.Писманик «Светская школа и религия» // Социально-гуманитарные знания. 2000. № 4, с.67). Фактически это позволяет ввести церковную экспертизу общеобразовательных светских программ, что недопустимо (Комкова Г.Н. «Реализация равенства прав и свобод человека независимо от отношения к религии в современной России». // Правоведенье 2003. № 1, с.27). Если такая политика государства и дальше будет иметь место, то Русская православная церковь станет не просто признанной, а государственной церковью с правом решать вопросы, не имеющие к религии никакого отношения.
Участие Московской Патриархии в формировании внутриполитического климата России стало принято освещать с помощью средств массовой информации. Однако не все СМИ пользуются на этом поприще расположением церкви. Если журналисты проявляют «ненужный» интерес к общественно-политическим акциям церкви, на их головы сыплются «анафемы», бывают случаи и прямых оскорблений действием. В Красноярске, например, местный епископ, в День поминовения памяти жертв политических репрессий анафематствовал присутствовавших на церемонии сотрудников телекомпании «Афонтово». Во время съемок на Валааме священником была разбита телекамера съемочной группы «Мир». В Москве подобным образом пострадали журналисты «Времечка» (М.Ситников. «РПЦ в политическом пространстве современной России». http://www.ateism.ru/articles/sitnikov01.htm
).«В Законе содержится запрет на создание религиозных объединений в органах государственной власти, государственных учреждениях, органах местного самоуправления, воинских частях, а также в государственных и муниципальных организациях. А вот игумен Иоанн (Экономцев) расценивает как положительный опыт создание православных групп в государственных детских садах, в иных светских воспитательных и образовательных учреждения, даже в воинских частях.
Например, в 1996 году, в Новосибирске, при Высшем военно-командном училище ВВ МВД РФ открылся факультет «Духовно-нравственные основы российского воинства». Пять отделений – литературное, художественное, поисковое, музыкальное и объединение «Русь Державная» – опирались в своей работе на три основные идеи: православие, державность государства российского и святость воинского долга.
Под чутким руководством Отдела по взаимодействию с Вооруженными Силами и правоохранительными учреждениями при Московской Патриархии стали появляться православные военные части, набор в которые производился военкоматами по вероисповедному признаку. Выступая в одной из таких частей, Патриарх отметил даже, что «воинский долг и подвиг имеет в настоящее время особенно важное значение и требует от тех, кто принимает его на себя, особо серьезного отношения к сохранению православной традиции российской государственности» (8.11.1997, в/ч МО МВД РФ. М.Ситников. «РПЦ в политическом пространстве современной России». http://www.ateism.ru/articles/sitnikov01.htm
).Такое участие церкви очевидно способствует расколу общества и государственных институтов по религиозному принципу. На это указывал Председатель Совета Муфтиев России Равиль Гайнутдин, который сказал, что «нельзя в многонациональном, многоконфессиональном государстве делить армию на полки по вероисповеданиям. Если сегодня создаются христианские полки, значит необходимо будет создавать в дальнейшем и мусульманские, и буддийские, и иудейские. Если у нас одно отечество, мы должны защищать его сообща».