В том же сентябре анархиствующие матросы, бросили охраняемую ими железную дорогу и отправились «гулять» в Вологду, где, после серии грабежей, устроили антисоветский мятеж, который с трудом подавили латышскими стрелками.
Несмотря на творимые матросами безобразия, начиная с лета 1918 года, на Север постоянно направлялись все новые и новые матросские отряды, т. к. альтернативы им у Советской власти тогда просто не было. Так еще в июле из Москвы на Северный фронт выехала большая часть 1-го морского берегового отряда. В начале августа из Петрограда на Север был направлен 2-й экспедиционный отряд балтийских моряков, который сразу по прибытии вступил в бой с войсками интервентов у станции Обозерская. Особенно широко развернулась отправка матросов на Север после распоряжения В.И. Ленина Высшему военному Совету от 9 августа 1918 года. В тот же день оперативный отдел Наркомвоена приказал штабу Петроградского военного округа отправить отряды матросов в Вологду. Комиссар Петроградского округа Б.П. Позерн телеграфировал В. И. Ленину об исполнении приказания. Матросский отряд, получивший наименование 4-го экспедиционного отряда балтийских моряков, и насчитывавший более тысячи матросов, 18 августа прибыл в Котлас и уже спустя два дня вступил в бой с наступавшими войсками интервентов. При этом матросы не только остановили продвижение противника, но сами перешли в контрнаступление и, несмотря на численный перевес противника, заняли несколько деревень на Северной Двине. Наряду с береговыми отрядами командованию Балтийского флота на Север была отправлена и гидроавиация. Прибыл на Северный фронт, построенный в Петрограде и укомплектованный матросами, бронепоезд «Красный моряк», который успешно действовал против белых бронепоездов.
Если в январе 1919 года белые части на севере России насчитывали около 10 тысяч штыков и сабель, то уже к июлю численность русских войск в Северной области достигла 25 тысяч человек. Основными направлениями действий белых являлись Мурманский и Архангельский фронты.
Со своей стороны Советы так же наращивали численность своих войск на Севере. Особый упор при этом делался на балтийских матросов, которые считались самыми боевыми и надежными. Помимо собственно матросских отрядов, с осени 1918 года на Север стали направляться матросские маршевые роты для пополнения частей Красной армии. Особенно много матросов было направлено для пополнения армейских частей в январе 1919 года.
История сохранила нам боевые подвиги наиболее значительных матросских отрядов. Так с лета 1918 года активно воевал на Северном фронте под Вологдой, а с августа 1918 года – в составе Архангельского района Северо- Восточного участка отрядов завесы, сформированный в конце июля 1918 года в Кронштадте и Петрограде 2-й экспедиционный отряд моряков Балтийского флота, которым командовал С.К. Шиманский. Ведя активные бои с частями Северного фронта, английскими и французскими войсками, отряд нес большие потери, но постоянно пополнялся матросами Балтийского флота. Для поддержки частей РККА и отряда судов Северо-Двинской бригады кораблей на северодвинском направлении 18 августа 1918 года в Кронштадте был сформирован 4-й экспедиционный отряд матросов Балтийского флота под командованием матроса-анархиста А.М. Андреева В состав отряда вошло до тысячи матросов-добровольцев, в основном, с линкоров «Полтава», «Севастополь», «Тангут». «Петропавловск» и «Республика», крейсеров «Громобой», «Россия» и «Рюрик», Минной дивизии, военных транспортов, а также матросов из состава 1-го Морского берегового отряда.
При этом военно-морским командованием создавались отряды матросов не только для боевых действий на направлениях, непосредственно связанных с наступлением интервенционистских и белых войск. Отряды формировались в спешном порядке для ликвидации прорывов фронтов и других экстраординарных задач. Так, в начале ноября 1919 года в район Яренска прорвалась через линию фронта 1-я Особая Вычегодская рота капитана Орлова. Объединившись с местными антисоветскими элементами, части белых войск захватили города Яренск и Усть-Сысольск. Группировка противника, достигшая примерно 700 человек с 18 пулемётами, создала угрозу тылам 6-й отдельной армии. Для разгрома группировки противника 4 ноября на Северо-Двинской военно-речной флотилии был сформирован 1-й морской батальон под командованием матроса И.А. Мякишева, которому были оперативно подчинены несколько красноармейских и чекистских подразделений и партизанских отрядов, общей численностью до 800 человек. Сформированный морской батальон и решил поставленную перед ним задачу по разгрому зарвавшегося противника.
1 августа в составе войск Беломорского района у станции Обозерская успешно сражался 2-й сводный Петроградский отряд матросов. 24 октября на усиление артиллерийских частей 6-й армии с Балтийского флота прибыло 9 120-мм орудий с боезапасом и артиллерийской прислугой.